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醫(yī)療科技 正文
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華為云醫(yī)療智能體喬楠: 基于EIHealth平臺的抗疫全景解讀

本文作者: 李雨晨 2020-07-13 20:49
導語:EIHealth主要覆蓋基因組,臨床研究和藥物研發(fā)三個方向。

雷鋒網(wǎng)消息,7月10-11日,2020世界人工智能健康云峰會召開。作為世界人工智能大會云端峰會的主題論壇之一,健康云峰會以“智聯(lián)世界·共享健康”為主題,由“1個開幕式+3場專題論壇+1場特色會議”構成,聚焦“AI+健康”“AI+公共衛(wèi)生”“AI+醫(yī)療服務”“AI+生物醫(yī)藥”“AI+醫(yī)療標準規(guī)范”等熱點話題。

在“AI+醫(yī)療服務”專場上,華為技術有限公司云醫(yī)療智能體喬楠博士發(fā)表了主題為《華為云EIHealth 科技抗疫 共克時艱》的主題演講。

華為云醫(yī)療智能體喬楠: 基于EIHealth平臺的抗疫全景解讀

喬楠表示,在醫(yī)療行業(yè),華為云的EIHealth平臺致力于打造醫(yī)療行業(yè)人工智能的“黑土地”,支撐生物技術公司、醫(yī)院、制藥公司等進行AI和數(shù)字化轉型,突入行業(yè)的深水區(qū),找到業(yè)務發(fā)展的第二曲線。他還講到,目前,EIHealth主要覆蓋基因組、臨床研究和藥物研發(fā)三個方向。

在此次抗擊新冠肺炎的戰(zhàn)斗中,EIHealth在以上三個領域取得了諸多成果,多方面助力抗疫,實現(xiàn)了平臺自身價值的最大化。

例如,在武漢,武漢希望組和華為組成聯(lián)合團隊,在無固定IT基礎設施的臨時醫(yī)院,實現(xiàn)并驗證了基于三代測序技術的新冠病毒快速基因檢測技術。

在廣東,華為云EI團隊協(xié)助廣東省再生實驗室,加速新冠肺炎影像AI模型開發(fā),完成新冠肺炎影像AI模型訓練,并且聯(lián)合華中科技大學、藍網(wǎng)科技共同推出AI輔助醫(yī)療影像篩查服務。服務整合了華為云端的AI+CT推理服務,可以直接給到醫(yī)院供臨床醫(yī)生使用。

以下為喬楠的演講內容,雷鋒網(wǎng)作了不改變原意的編輯及整理:

喬楠:大家下午好,非常感謝世界人工智能大會組委會的邀請,也很榮幸參加這次“智聯(lián)世界 共享健康”上海云峰會。

今天我要給大家介紹的是華為云的EIHealth平臺。在這次抗疫中,EIHealth推出了一系列的抗疫黑科技,支撐國內外高校、研究機構、醫(yī)療和合作伙伴,一起利用科技抗疫、共克時艱。

華為聚焦于ICT技術,也就是信息與通信技術,面向消費者、運營商和企業(yè)三類客戶群,提供創(chuàng)新的端到端的ICT解決方案和產(chǎn)品,包括智能終端和可穿戴式設備,各種網(wǎng)絡互連設備,以及云計算。

消費者業(yè)務、運營商業(yè)務、企業(yè)業(yè)務和云業(yè)務是華為的核心四大業(yè)務領域。

華為每年在持續(xù)創(chuàng)新和自主研發(fā)上投入大量的人力和資源,2019年研發(fā)總投入1317億元,研發(fā)人員遍布全球的14個研究所和36個聯(lián)合創(chuàng)新中心。

華為現(xiàn)有3000多名AI專家,發(fā)表了200多篇AI文章,持有600多項AI專利,這些數(shù)字每天都在持續(xù)增加中。

2018年,徐直軍總裁正式對外宣布了華為的全棧、全場景AI戰(zhàn)略;2019年,胡厚崑總裁正式宣布華為的全站全場景AI戰(zhàn)略已經(jīng)落地,我們推出了最強的AI推理芯片昇騰310,AI訓練芯片昇騰910,以及通用計算的鯤鵬芯片。

我們在2020年的華為開發(fā)者大會上開源了可以媲美TensorFlow和Pytorch的MindSpore深度學習框架;而華為的一站式AI平臺ModelArts,在正式發(fā)布一年后,也推出了面向企業(yè)客戶的專業(yè)版。

針對企業(yè)客戶,我們不僅提供了通用的AI、API,如圖像識別,文本識別,也提供了面向軟件工程師的高級API,方便企業(yè)客戶的集成和應用,針對城市、互聯(lián)網(wǎng)、園區(qū)、醫(yī)療等行業(yè),我們進一步推出了EI智能體解決方案。

所有這些共同組成了華為云企業(yè)智能EI服務,打造人工智能的黑土地,使華為云成為企業(yè)智能化數(shù)字轉型的最佳合作伙伴。

華為云企業(yè)智能面向醫(yī)療行業(yè)推出的是EIHealth平臺。

近些年來,AI在醫(yī)療領域的研究和應用非?;钴S,我們希望通過EIHealth為醫(yī)療客戶提供一個端到端的AI研發(fā)平臺,從而加速AI的研究、AI知識資產(chǎn)的積累、AI成果的轉換應用。

更進一步的,推動AI的民主化。通過AutoML自動建模技術,讓每一個人都可以利用AI解決工作中遇到的問題。

EIHealth當前主要覆蓋三個方向:基因組、臨床研究和藥物研發(fā)。

華為云醫(yī)療智能體喬楠: 基于EIHealth平臺的抗疫全景解讀

在今年一月份疫期爆發(fā)初期,EIHealth團隊就投入到緊張的抗疫研發(fā)第一線,我們和國內的高校,研究機構以及合作伙伴一起,在基因組、臨床研究和藥物研發(fā)等多個領域取得了一系列的合作成果,并且在第一時間公開和公布了這些研究成果,為抗疫研究爭取了寶貴的時間。

為了更好的支持抗疫研發(fā),EIHealth通過整合華為2012實驗室多年的研究成果,迅速研發(fā)并上線了一系列抗疫科技,在國內外的抗疫工作中發(fā)揮了巨大的價值。

華為云醫(yī)療智能體喬楠: 基于EIHealth平臺的抗疫全景解讀

對于一種新型病毒,研究人員首先要做的是對該病毒的基因和蛋白進行深入的研究,接下來需要針對病毒研發(fā)檢測技術。最后,研究人員需要針對病毒研發(fā)藥物和抗體,這樣才能徹底打敗病毒。

EIHealth 抗病毒服務提供了覆蓋病毒研究、病毒檢測和抗病毒藥物研發(fā)者三個階段的多種功能,如病毒基因組研究、病毒進化研究、病毒蛋白結構研究、新冠肺炎AI+CT檢測、抗病毒藥物篩選和新冠AI圖譜,這些功能可以極大加速病毒的研究和抗疫新技術的研發(fā)。

在基因組領域,EIHealth提供了全面的工具和流程,覆蓋了二代測序和三代測序技術,使得研究人員可以快速進行病毒序列的檢測、病毒基因組的組裝、病毒突變的識別和病毒的進化分析。所有的這一切都可以在華為云端,利用華為云的強大算力迅速完成。

這里演示的是EIHealth平臺的病毒基因檢測流程,該流程通過分析病人的基因測序數(shù)據(jù),可以快速準確的識別出新冠病毒的基因序列,從而可以作為傳統(tǒng)病毒檢測技術的有效補充。

通過華為5G技術、華為云的鯤鵬芯片和昇騰芯片,我們將數(shù)小時的分析任務加速到了十分鐘以內,極大的提高了病毒檢測的效率。

在臨床研究領域,EIHealth研發(fā)了多個AI模型,用于對新冠肺炎的病灶分割和定量分析,對肺病病灶的3D重建,以及對病情演化的對比分析,這些AI模型的應用極大的提升了臨床醫(yī)生閱片的效率。

這里演示的是EIHealth平臺的AI輔助新冠肺炎篩查服務,該模型可以達到99%的敏感度和90%的精度。針對肺病病變的DICE系數(shù)可以達到0.82,AI輔助新冠肺炎篩查同樣可以作為傳統(tǒng)病毒檢測技術的有效補充,對病人的診斷結果進行交叉驗證,提高診斷的準確性。

通過華為昇騰AI芯片的加速,我們將AI模型的推理時間壓縮到數(shù)秒內完成。

EIHealth團隊在一月底和中科院、華中科大以及西安交大的數(shù)位教授和博士共同啟動了神農項目。

該項目在一周內,利用華為云的鯤鵬集群和昇騰集群的算力,針對21個病毒靶點以及8506個臨床藥物進行了虛擬篩選,并且將虛擬篩選的結果通過神農項目網(wǎng)站,面向全球進行公布。

這也是迄今為止全球最大的、完全免費公開的新冠藥物虛擬篩選數(shù)據(jù)庫。研究人員和臨床醫(yī)生可以在神農項目網(wǎng)站上對病毒蛋白和藥物進行查詢,并能夠以3D可視化的形式展示病毒蛋白和藥物的結合位點。

這里演示的是支撐神農項目背的抗病毒藥物虛擬篩選服務,研究人員可以利用該服務,針對自己設計的病毒靶點和小分子藥物數(shù)據(jù)庫,進行超大規(guī)模的藥物虛擬篩選。

借助華為鯤鵬芯片和昇騰芯片的超強算力,我們可以將原本需要一個月的計算任務加速到幾個小時內完成。

由于新冠病毒是一種全新的病毒,對新冠病毒的研究在短短幾個月的時間里就積累了上萬篇文獻,如何能夠從文獻中提取準確有效的知識,從而啟發(fā)新的研究思路,并且避免重復性研究,已經(jīng)成為研究人員面臨的最大問題。

通過利用華為云的知識圖譜服務和2012實驗室發(fā)表的BERT-MK醫(yī)療預訓練模型,EIHealth迅速推出了新冠科研AI圖譜。

利用新冠科研AI圖譜,研究人員可以對自己感興趣的目標進行搜索,這里我們可以針對病毒的蛋白進行搜索,如Spike蛋白,搜索可以得到Spike蛋白的靶向蛋白,針對Spike蛋白的藥物或者抗體,這些信息所在的文獻段落及文獻鏈接會顯示在知識圖譜的下方;

同樣,我們可以搜索感興趣的藥物,如奈非那韋。最近有多篇文獻報道它可以抑制新冠病毒,通過知識圖譜查詢,我們可以看到奈非那韋的靶點蛋白是病毒的Mpro蛋白。

現(xiàn)在是技術創(chuàng)新的大時代,也是中國的企業(yè)往深水區(qū)邁進的關鍵階段,如何能夠加速科技創(chuàng)新及應用,已經(jīng)是各行業(yè)領頭羊能夠存活下去的關鍵因素。

在短短的幾個月里,我們不僅通過EIHealth平臺研發(fā)出了一系列黑科技,同時也和合作伙伴一起推動了這些技術的落地和應用,接下來我會為大家介紹最近我們取得的合作成果。

1月30號,武漢希望組和華為組成聯(lián)合團隊,在無固定IT基礎設施的臨時醫(yī)院,實現(xiàn)并驗證了基于三代測序技術的新冠病毒快速基因檢測技術。

當測序儀產(chǎn)生數(shù)據(jù)后,基因數(shù)據(jù)通過5G網(wǎng)絡傳輸給華為云,然后利用華為云服務與AI技術,快速分析得到病毒檢測結果。該技術在抗疫初期發(fā)揮了重要的作用。

2月10日,在華為云技術團隊的支持下,中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所和上海巴斯德所,正式上線了新冠病毒基因自動化鑒定云平臺,并在疫情期間免費開放。

該平臺為新冠基因組分析提供了一鍵式自動化服務,為新冠病毒臨床診斷,病毒變異趨勢監(jiān)控提供了重要的依據(jù)。還在上海市公共衛(wèi)生臨床中心,瑞金醫(yī)院及多家醫(yī)療機構的患者基因數(shù)據(jù)分析中得到了廣泛的使用。

2月2號,為了支持廣東省再生實驗室新冠肺炎影像AI模型的訓練,華為云緊急調度了一批AI訓練服務器,確保了再生實驗室研究任務的順利完成。

2月8號,華為云和華中科技大學,藍網(wǎng)科技共同研發(fā)的AI輔助醫(yī)療影像篩查服務正式上線,該服務整合了華為云端的AI、 CT推理服務,并可以直接部署到醫(yī)院供臨床醫(yī)生使用。

4月2號,隨著華為云全球抗疫行動的全面展開,在合作伙伴藍網(wǎng)科技、心醫(yī)國際和東軟集團的共同努力下,EIHealth服務已經(jīng)進入全球100余家醫(yī)院。

從2月1號開始,由華為和中科院北京基因組研究所、華中科大、西安交大多名教授和博士組成的聯(lián)合科研團隊陸續(xù)發(fā)布了一系列的成果,其中包括新冠病毒所有關鍵蛋白的同源模建結構,針對Mpro蛋白藥物篩選找到五個可能有效的藥物,其中有兩個藥物已經(jīng)進入了臨床實驗。

在4月2號,聯(lián)合團隊將這次大規(guī)??剐鹿谒幬锖Y選的所有數(shù)據(jù),發(fā)布到了神農項目網(wǎng)站上,迄今為止,神農項目已有755次國內外訪問,并且有多篇基于神農項目的科研成果也陸續(xù)發(fā)表了出來。

從2月10日開始,華為聯(lián)合浙江大學發(fā)布了多個新冠科研AI知識圖譜,該AI圖譜采用了華為2012實驗室和華為云最新研究成果,領先的醫(yī)學領域知識監(jiān)督預訓練語言模型:BERT-MK,并融合了團隊在知識挖掘領域積累的多項深度語義表示和檢索技術。

新冠科研AI知識圖譜通過OpenKG面向全球公開訪問,迄今為止,已有超過1800次下載量。

華為云當前在中國公有云市場排名第三,全球排名第六,華為云也是全球唯一一個具有全棧全場景AI能力的云廠商,這些都為國家新基建的落地提供了堅實的基礎。

今天我給大家的分享就到這里,希望能對大家有所幫助,謝謝大家!雷鋒網(wǎng)

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