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醫(yī)療AI 正文
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劑泰醫(yī)藥CEO賴(lài)才達(dá):人人都做新藥分子,我們?yōu)槭裁慈プ鲋苿┢脚_(tái)?

本文作者: 劉海濤 2021-06-18 14:18
導(dǎo)語(yǔ):劑泰醫(yī)藥,由AI藥物晶型研發(fā)公司晶泰科技孵化而來(lái),聚焦在藥物遞送、制劑研發(fā)賽道,這也是一條頗有特色的賽道。

十一年前,張小龍找來(lái)10個(gè)開(kāi)發(fā)員,在一間封閉開(kāi)發(fā)的辦公室(被稱(chēng)為“小黑屋”),開(kāi)始沒(méi)日沒(méi)夜的開(kāi)發(fā)微信;那一年,新浪成為了極少數(shù)主營(yíng)業(yè)務(wù)轉(zhuǎn)型成功的互聯(lián)網(wǎng)企業(yè),新浪微博用戶基礎(chǔ)在一年時(shí)間就擴(kuò)大了25倍之多。

從今天的成效來(lái)看,微信、新浪微博、小米、美團(tuán)、陌陌等所有勇于選擇的創(chuàng)業(yè)者,在那一年都抓了最好的時(shí)代,收獲了自己的成功。

如今,同樣的故事或許正在生物制藥行業(yè)上演。

近期,雷鋒網(wǎng)《醫(yī)健AI掘金志》以“AI制藥·下一個(gè)現(xiàn)象級(jí)賽道”為主題,邀請(qǐng)了百圖生科、劑泰醫(yī)藥(METiS)、未知君、望石智慧、英矽智能、星藥科技等六家先鋒企業(yè),進(jìn)行了一場(chǎng)線上云峰會(huì)分享。

此前,我們陸續(xù)推出五位嘉賓的演講精編:《百圖生科科學(xué)顧問(wèn)高欣》;《未知君首席生信科學(xué)家胡函》;《望石智慧高級(jí)算法專(zhuān)家周文彪》;《英矽智能首席科學(xué)官任峰》;《星藥科技CEO李成濤》,感興趣的讀者可以拓展閱讀。

我們希望,通過(guò)見(jiàn)證這些最勇敢的創(chuàng)業(yè)者,能夠見(jiàn)證一個(gè)新賽道的崛起與未來(lái)。

作為該系列的最后一篇演講內(nèi)容,劑泰醫(yī)藥CEO賴(lài)才達(dá)圍繞新藥制劑開(kāi)發(fā)談了很多自己的心得體會(huì)。

METiS 劑泰醫(yī)藥由AI藥物晶型研發(fā)公司晶泰科技孵化而來(lái),公司繼承了晶泰科技的 AI 實(shí)力,并選擇聚焦于藥物遞送、制劑研發(fā)賽道,是全球首家以 AI 驅(qū)動(dòng)的藥物制劑開(kāi)發(fā)初創(chuàng)公司。

其可以為生物制藥公司提供制劑開(kāi)發(fā)和優(yōu)化服務(wù),同時(shí)也會(huì)基于其專(zhuān)有的高通量 AI 制劑平臺(tái)搭建制劑新藥管線等。

他表示,現(xiàn)在越來(lái)越多新藥分子面臨制劑開(kāi)發(fā)困難。

首先90%小分子本身就面臨藥物動(dòng)力學(xué)問(wèn)題,例如通透性差、溶解度差等現(xiàn)象,這都對(duì)最后成藥性造成極大影響。

其次就是新型態(tài)藥物(New Modalities),例如核酸藥物的靶向遞送,這更加考驗(yàn)材料和制劑優(yōu)化方式。

開(kāi)發(fā)者希望知道大分子結(jié)構(gòu)和不同輔料、納米材料如何交互作用,在不同生理微環(huán)境下條件,有什么樣物理和動(dòng)力學(xué)性質(zhì)差異。

但迄今為止,基本沒(méi)有一個(gè)特別好的算法可以連接,微觀尺度分子及制劑交互作用和宏觀尺度藥物動(dòng)力學(xué)性質(zhì)。

傳統(tǒng)的制劑開(kāi)發(fā)手段,更像是手藝活,非常仰賴(lài)專(zhuān)家經(jīng)驗(yàn)法則,專(zhuān)家依據(jù)分子預(yù)測(cè)其性質(zhì),做簡(jiǎn)單試錯(cuò),能夠搜尋空間非常有限。

所以更需要AI來(lái)驅(qū)動(dòng)新藥制劑開(kāi)發(fā),幫助了解藥物遞送本質(zhì)以及原理和性質(zhì),進(jìn)一步大幅提升藥物開(kāi)發(fā)效率,提升傳統(tǒng)制劑開(kāi)發(fā)手段。

在此背景下,劑泰醫(yī)藥推出了AI驅(qū)動(dòng)制劑開(kāi)發(fā)平臺(tái)AiTEM,其中包含可生成處方及工藝的大數(shù)據(jù)高通量藥物遞送及制劑平臺(tái),以及以分子模擬及人工智能預(yù)測(cè)藥物物理及動(dòng)力學(xué)性質(zhì)的計(jì)算平臺(tái)。

依托該平臺(tái),劑泰在成立不到一年情況下,就相繼獲得華海藥業(yè)、博騰醫(yī)藥兩家知名上市藥企的合作支持。今年以來(lái)劑泰醫(yī)藥已經(jīng)累計(jì)完成了三輪融資,其中不乏紅杉資本中國(guó)、五源資本(原晨興資本)等知名 VC。

以下為賴(lài)才達(dá)演講內(nèi)容,《醫(yī)健AI掘金志》做了不改變?cè)獾恼砗途庉嫞?/strong>

大家好,我是METiS劑泰醫(yī)藥CEO賴(lài)才達(dá),非常高興分享我們的項(xiàng)目。

METiS致力于AI驅(qū)動(dòng)新藥制劑開(kāi)發(fā),尤其是drug delivery(藥物遞送)環(huán)節(jié)。

我們的愿景是致力于成為新藥遞送的設(shè)計(jì)師,其中主要包含以下三點(diǎn):

通過(guò)提高BA、穩(wěn)定性來(lái)提升大、小分子成藥性;

改善藥物釋放控制,得到更好藥物效果;

通過(guò)新藥遞送系統(tǒng),設(shè)計(jì)臨床差異化制劑新藥,也就是505b2二類(lèi)新藥。

公司最早由美國(guó)工程院院士創(chuàng)立技術(shù)構(gòu)想,并由晶泰科技孵化算法基礎(chǔ);

我們的目標(biāo)是把高通量平臺(tái)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)結(jié)合算法,去計(jì)算一個(gè)分子與成千上萬(wàn)個(gè)分子之間的交互作用,最終把微觀尺度信息和宏觀尺度的物理動(dòng)力學(xué)性質(zhì)關(guān)聯(lián)在一起。

通過(guò)這樣的構(gòu)想,我們完成了全世界第一個(gè)AI驅(qū)動(dòng)新藥制劑以及藥物遞送開(kāi)發(fā)平臺(tái)構(gòu)建。

目前,該平臺(tái)已經(jīng)推動(dòng)幾種藥物開(kāi)發(fā),從去年底開(kāi)始到現(xiàn)在,已經(jīng)開(kāi)發(fā)十幾個(gè)PCC項(xiàng)目,預(yù)計(jì)今年可以申報(bào)第一個(gè)IND,這也體現(xiàn)AiTEM平臺(tái)可以規(guī)?;?,有效率產(chǎn)生臨床差異化管線。

今天主要介紹平臺(tái)技術(shù)機(jī)理,包括怎樣預(yù)測(cè)、設(shè)計(jì)、優(yōu)化制劑遞送材料,此外也會(huì)結(jié)合一些案例,通過(guò)平臺(tái)講解怎樣產(chǎn)生臨床差異化管線。

我們一般認(rèn)為藥物遞送都是在小分子環(huán)節(jié),但目前提升藥物遞送已成為新一代藥物的核心部分。

例如PROTAC或核酸藥,這種新化學(xué)分子原件非常需要以遞送為核心手段去成藥。

此外,我們?cè)陂_(kāi)發(fā)平臺(tái)過(guò)程中,也發(fā)現(xiàn)很多傳統(tǒng)手段都需要革新。

傳統(tǒng)制劑開(kāi)發(fā)手段,更像是手藝活,非常仰賴(lài)于專(zhuān)家經(jīng)驗(yàn)法則,專(zhuān)家依據(jù)分子預(yù)測(cè)其性質(zhì),做簡(jiǎn)單試錯(cuò),能夠搜尋的空間非常有限。

所以在這個(gè)環(huán)節(jié)中,AI制劑設(shè)計(jì)的價(jià)值會(huì)非常大,會(huì)從綠葉輔助陪伴成為真正的核心環(huán)節(jié)。

首先第一個(gè)價(jià)值點(diǎn),505b2改良型新藥開(kāi)發(fā)。

目前,美國(guó)已經(jīng)有很多藥企都在這方面投入,類(lèi)似Reata, Recursion等公司就主要做藥物重定向、老藥新用開(kāi)發(fā)。

劑泰打造的AiTEM平臺(tái)主要用于找尋老藥新用機(jī)會(huì),滿足臨床缺陷,并進(jìn)一步研究藥物PK、PD性質(zhì),在3~6個(gè)月內(nèi)完成立項(xiàng)到藥物制劑開(kāi)發(fā)(非CMC工藝開(kāi)發(fā))。 

第二個(gè)價(jià)值點(diǎn),新形態(tài)藥物核心環(huán)節(jié)藥物遞送,將藥物包裹在納米載體內(nèi),靶向遞送到對(duì)應(yīng)組織或靶向細(xì)胞中。

例如把mRNA、Base editor等復(fù)雜分子,高效送到特定細(xì)胞里,在這方面的材料設(shè)計(jì),多元組份設(shè)計(jì)復(fù)雜度會(huì)大幅度提升,這也是我們的開(kāi)發(fā)重點(diǎn)。

METiS是先從底層了解小分子藥物與輔料之間的交互作用,再進(jìn)一步了解RNA、多肽、甚至抗體或蛋白等大分子與輔料之間的交互作用。

那我們是怎樣切入AI藥物遞送這一賽道的?

自己和團(tuán)隊(duì)還在晶泰內(nèi)部時(shí),就發(fā)現(xiàn)越來(lái)越多藥物分子,像NCE、多肽,或siRNA等復(fù)雜藥物分子,都面臨劑型開(kāi)發(fā)困難。

光是小分子就有90%藥物面臨藥物動(dòng)力學(xué)問(wèn)題,例如通透性差、溶解度差等。

這都會(huì)對(duì)成藥性造成影響。相比藥物分子篩選,醫(yī)藥行業(yè)里面更加缺少一個(gè)更先進(jìn)的藥物遞送工具。

在和很多大藥企合作的時(shí)候,他們經(jīng)常上來(lái)就問(wèn)我們,是否可以設(shè)計(jì)一套計(jì)算工具用在開(kāi)發(fā)環(huán)節(jié),從而實(shí)現(xiàn)知道分子結(jié)構(gòu)之后,即可快速了解其在不同輔料,不同工藝條件,不同環(huán)境下有怎樣的物理跟動(dòng)力學(xué)性質(zhì)。

一開(kāi)始我們運(yùn)用傳統(tǒng)方法計(jì)算,例如CADD工具,試圖解釋一個(gè)分子在復(fù)雜輔料環(huán)境下,會(huì)有什么物理性質(zhì),但并沒(méi)有得到理想結(jié)果。

看到這個(gè)痛點(diǎn)之后,我們又是怎樣決定出來(lái)創(chuàng)業(yè)的?

傳統(tǒng)制劑開(kāi)發(fā)過(guò)去非常仰賴(lài)專(zhuān)家經(jīng)驗(yàn),可能先是從單一材料或幾種材料結(jié)果去預(yù)測(cè)優(yōu)化條件,采用試錯(cuò)方式,數(shù)量非常有限,搜尋空間也非常有限。

看到這個(gè)痛點(diǎn)之后,結(jié)合自己這么多年的AI學(xué)習(xí)和研發(fā)經(jīng)驗(yàn),我就問(wèn)自己:“既然AI可以篩選分子結(jié)構(gòu)、進(jìn)行疾病預(yù)測(cè),那能不能應(yīng)用到藥物遞送環(huán)節(jié)當(dāng)中?!?/p>

剛開(kāi)始有這個(gè)設(shè)想的時(shí)候,自己還比較緊張,因?yàn)槲覀兛聪聛?lái),光設(shè)計(jì)元件的選擇,載體參數(shù)設(shè)計(jì),宏觀配方、處方工藝條件篩選,大概就有1010到1020以上設(shè)計(jì)空間。

在這么大挑戰(zhàn)下,最開(kāi)始我們就透過(guò)AI把設(shè)計(jì)空間給框出來(lái),然后用virtual screening(虛擬篩選)方式做初篩。

初篩完之后,再到高通量試驗(yàn)平臺(tái)上做迭代,迭代結(jié)果重新輸入到AI系統(tǒng)以進(jìn)一步優(yōu)化試驗(yàn),循環(huán)迭代試驗(yàn)可以在數(shù)萬(wàn)級(jí)數(shù)據(jù)空間內(nèi)大幅提升專(zhuān)家效率。

這種底層技術(shù)可以幫助我們了解藥在微環(huán)境下的性質(zhì),透過(guò)這個(gè)性質(zhì)再去預(yù)測(cè),去優(yōu)化,就可以解決臨床上需要面臨的問(wèn)題,跨維度、跨不同物理尺度優(yōu)化藥物制劑開(kāi)發(fā)技術(shù)。

為什么除了我們還沒(méi)有任何一家AI公司布局這個(gè)方向?

其中最主要原因就是缺乏底層基礎(chǔ),也就是沒(méi)有公開(kāi)大數(shù)據(jù)庫(kù)做 data training,現(xiàn)在公開(kāi)數(shù)據(jù)庫(kù)大概只有幾千例數(shù)據(jù),很難做訓(xùn)練。

而且其還缺乏CADD量子力場(chǎng)計(jì)算工具、沒(méi)有高通量實(shí)驗(yàn)平臺(tái)等,這些先天缺陷,讓其他企業(yè)沒(méi)有辦法驅(qū)動(dòng)訓(xùn)練 AI學(xué)習(xí)系統(tǒng)。

從核心優(yōu)勢(shì)角度來(lái)講,劑泰主要完成三個(gè)核心技術(shù)突破:

(1) 高通量量子化學(xué)算法, 計(jì)算API分子與多元輔料交互作用;

(2) 高通量實(shí)驗(yàn)?zāi)=M,針對(duì)各個(gè)劑型模擬藥物遞送的生產(chǎn)工藝及生理遞送微環(huán)境;

 (3) AI算法完成虛擬篩選及優(yōu)化制劑設(shè)計(jì)及組合篩選。

通過(guò)計(jì)算及高通量實(shí)驗(yàn),完成迭代式學(xué)習(xí)推薦,最終生成制劑處方,完成后續(xù)的產(chǎn)品開(kāi)發(fā),所以平臺(tái)是真正用數(shù)字化計(jì)算表征藥物的遞送平臺(tái)。

通過(guò)這樣的平臺(tái),主要可以做三件事:

第一,分子成藥性?xún)?yōu)化,通過(guò)制劑優(yōu)化即工藝處方優(yōu)化、提升創(chuàng)新分子結(jié)構(gòu)本身成藥性。

第二,藥物遞送系統(tǒng)(DDS)方案設(shè)計(jì),透過(guò)我們平臺(tái)設(shè)計(jì)不同DDS方案,滿足臨床缺陷。

第三,老藥新用產(chǎn)品開(kāi)發(fā),從立項(xiàng)到IND全流程開(kāi)發(fā)平臺(tái)。

更具體地來(lái)說(shuō),第一個(gè)是成藥性?xún)?yōu)化過(guò)程。

對(duì)每一個(gè)劑型里,每一個(gè)輔料進(jìn)行解構(gòu),新分子進(jìn)來(lái)后,和解構(gòu)單元體進(jìn)行量子化學(xué)計(jì)算其交互作用,以此表征分子在該環(huán)境下的物理性質(zhì),快速篩選一個(gè)藥在新遞送條件的特征(Features)。

本來(lái)可能要花幾個(gè)月,甚至一年去完成的復(fù)雜計(jì)算,現(xiàn)在只要幾分鐘到一小時(shí)就可以完成,這是底層算法的一個(gè)重大突破。

以固體分散體為例,該劑型是透過(guò)無(wú)定形分子型態(tài)幫助藥物增溶。

在無(wú)定型狀態(tài)下,尋找高分子輔料加強(qiáng)藥物分子在Solid Dispersion下的穩(wěn)定狀態(tài),這樣可以避免藥物分子重新結(jié)晶,增加其溶解度,從而提高生物利用度。

其中最主要問(wèn)題在于,需要知道藥物分子怎樣與各種高分子載體相互作用?

我們能夠了解最底層作用機(jī)制,在固分體里API分子怎么與載體交互作用,以及他們相互分布是什么樣子,從而預(yù)測(cè)藥物會(huì)不會(huì)穩(wěn)定,溶解度或溶出速率是否會(huì)提高。

其中固分體開(kāi)發(fā)往往會(huì)面臨兩個(gè)矛盾,當(dāng)想提高固分體生物利用度時(shí),需要化學(xué)勢(shì)能盡可能大,但當(dāng)API過(guò)飽和度時(shí),又會(huì)增加API重結(jié)晶的風(fēng)險(xiǎn)。

就像很多藥企在開(kāi)發(fā)時(shí)遇到的困境,找到一種生物利用度很高的ASD,但在開(kāi)發(fā)藥物臨床二期時(shí),卻發(fā)現(xiàn)這種ASD不穩(wěn)定,再重新結(jié)晶會(huì)大幅度影響開(kāi)發(fā)效率跟周期。

劑泰主要依據(jù)AI和計(jì)算平臺(tái)去預(yù)測(cè)化學(xué)勢(shì)能和穩(wěn)定性,虛擬篩選材料并進(jìn)行處方及工藝條件優(yōu)化, 解決這類(lèi)矛盾,設(shè)計(jì)不同高分子與藥物組分,提升他的driving force,然后又能夠提升穩(wěn)定活化能。

我們?cè)趯?shí)際反應(yīng)條件里做ASD成分優(yōu)化,大家也知道這個(gè)篩選過(guò)程很艱難,運(yùn)用高分子載體數(shù)據(jù)庫(kù),選擇合適試劑,然后通過(guò)高通量訓(xùn)練,構(gòu)建AI模型或分子模擬進(jìn)行預(yù)測(cè)。

整個(gè)過(guò)程中確實(shí)是可以找到一些非常有趣的結(jié)果,除了預(yù)測(cè)穩(wěn)定性之外,甚至可以找到非常多,專(zhuān)家找不到的處方條件,從而幫助專(zhuān)家突破本來(lái)trial-and-error和靠經(jīng)驗(yàn)法則時(shí)的決策誤區(qū)。

以上就是我們核心的優(yōu)勢(shì),對(duì)非線性數(shù)據(jù)進(jìn)行歸納整理,建立預(yù)測(cè)能力幫助輔料優(yōu)化及多元輔料篩選,甚至工藝條件篩選,進(jìn)而優(yōu)化藥物載藥量,溶出條件,穩(wěn)定性等。

從簡(jiǎn)單液體制劑,到固體分散體,直壓,甚至更復(fù)雜微球、透皮,這種大分子利用平臺(tái)聚合物膠束/脂質(zhì)納米粒等等。

在這一系列都可以從這些底層交互作用去做材料設(shè)計(jì),甚至新材料設(shè)計(jì)來(lái)做DDS技術(shù)優(yōu)化。

就像我前面介紹,DDS是未來(lái)開(kāi)發(fā)新藥非常重要的一個(gè)方向,不管我們做制劑開(kāi)發(fā)、還是小分子藥物遞送、mRNA藥物遞送,如果有能力破解這些底層遞送核心問(wèn)題,就可以滿足專(zhuān)家非常難優(yōu)化的這些條件。

當(dāng)我們把DDS解決之后,結(jié)合老藥新用平臺(tái),開(kāi)發(fā)滿足臨床需求的產(chǎn)品,才是我們真正的初衷。

與505b1創(chuàng)新藥不一樣,505b2不需改變分子本身結(jié)構(gòu),通過(guò)改變遞送方式或適應(yīng)癥方向從而滿足臨床缺陷,就可以明顯提高成藥成功率。

我們希望可以快速實(shí)現(xiàn)立項(xiàng)到臨床驗(yàn)證的閉環(huán),從而實(shí)現(xiàn)閉環(huán)學(xué)習(xí)過(guò)程。

整個(gè)AiTEM平臺(tái)搭建基本就是從臨床開(kāi)始,挖掘大量數(shù)據(jù),找出不同適應(yīng)癥領(lǐng)域藥物開(kāi)發(fā)機(jī)會(huì),如CNS、慢性腎病、代謝性疾病、疼痛性疾病、甚至是許多腫瘤性疾病。

開(kāi)發(fā)思路有兩種,

一種是跟遞送相關(guān),例如減毒增效,提升病人依從性;

二是改變適應(yīng)癥,解決無(wú)藥可用的問(wèn)題,從立項(xiàng)一路到POC,大概3~6個(gè)月就可以完成。

以抗癌的一線用藥紫杉醇為例,因?yàn)楸旧砜扇苄院统伤幮詥?wèn)題,原研使用蓖麻油衍生物,存在一定過(guò)敏性問(wèn)題。雷鋒網(wǎng)

我們嘗試去掉不良條件,透過(guò)簡(jiǎn)單制劑來(lái)滿足成藥性質(zhì),實(shí)現(xiàn)雙倍劑量,達(dá)到減毒增效作用,最終目標(biāo)是讓毒性和工藝成本都明顯降低。

通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)、強(qiáng)化學(xué)習(xí)方法,最終篩選大概到106次到107設(shè)計(jì)空間,做全局優(yōu)化,這種數(shù)量已經(jīng)遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)目前專(zhuān)家能力,在大的設(shè)計(jì)空間中找到最優(yōu)條件,再做動(dòng)物試驗(yàn),得到很好結(jié)果。

其實(shí),劑泰不僅做制劑開(kāi)發(fā)的效率提升,更多是透過(guò)搜尋能力提升之后,找到專(zhuān)家找不到的成藥機(jī)會(huì)。

我們的愿景也是成為一個(gè)擁有算法平臺(tái)+高通量試驗(yàn)平臺(tái)+立項(xiàng)平臺(tái)+管線轉(zhuǎn)化平臺(tái)的生物科技企業(yè)。

今天非常高興介紹我們的項(xiàng)目,AI drug delivery是一種顛覆性技術(shù),通過(guò)這樣手段可以初步從小分子藥布局進(jìn)行改良性新藥開(kāi)發(fā),下一步將開(kāi)發(fā)具有靶向作用的核酸技術(shù)平臺(tái),把更多好藥提供給患者。雷鋒網(wǎng)

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