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本文作者: 張馳 | 2016-12-29 10:36 |
基因測序可以簡單理解為,把生命數(shù)字化的過程。基于這些數(shù)據(jù),可以實現(xiàn)健康管理、遺傳疾病診斷、個性化醫(yī)療等。
1990年正式啟動的人類基因組計劃,預算是30億美元;而到2007年,測序成本就降到100萬美金了;現(xiàn)在則是在1000美元以下。成本的降低,使得基因測序應用范圍擴大,普通用戶也可以享受到檢測服務(雖然實際作用還很難說)。作為上游測序儀廠商,從下圖Illumina公司的股價走勢也可以看出,基因檢測市場及對其需求的快速增長。
Illumina上市以來股價走勢圖
Illumina、華大基因等公司測序儀技術的成熟(納米孔技術,基于硅基的光電技術),解決了測序問題,將生命轉換成數(shù)字,這樣就進入了生物信息領域,即怎么樣去理解這些以前沒有的數(shù)字信號,理解生命編碼信息。這也是華點云所做的事。
所謂生物信息技術,是在特定領域的數(shù)據(jù)處理和挖掘技術。測序所得數(shù)據(jù),需要經過生物信息技術處理,才能從數(shù)據(jù)中得出與健康疾病等應用相關的結果,并傳遞給終端用戶。
華點云產品及運營合伙人陳杰告訴雷鋒網,公司處在從上游儀器到下游應用(患病風險、疾病診斷)的產業(yè)鏈條中間,所做的事是把生物信息技術產品化、服務化,降低使用門檻,提供給下游提供基因服務的公司。目前公司提供有CelLoud生物信息云平臺。
陳杰表示,公司目前主要服務兩類用戶。
一是行業(yè)中做基因檢測產品及相應服務的公司。生物信息是產業(yè)鏈條中關鍵的一步,如果要做相應的服務,必然要用到生物信息技術。
二是醫(yī)院客戶,因為不管通過哪些基因檢測的產品或服務商,使用產品或報告的最終用戶都是醫(yī)生、醫(yī)院和健康管理機構。這些人對于服務的體驗,決定了能不能在市場里有相應的份額。
每個行業(yè)有不同的特點,處理的數(shù)據(jù)和數(shù)據(jù)應用類型不同,所以正如金融行業(yè)有金融云一樣,生物信息領域也有相應的云服務。
在陳杰看來,生物信息云是云應用里最繁雜的,因為由于其數(shù)據(jù)特點,有高頻的數(shù)據(jù)查詢分析需求,“比如,對于有沒有得某種疾病的突變位點,作為一個普適的健康應用時要考慮如何處理大量數(shù)據(jù)。我們在與合作伙伴共同開發(fā)乳腺癌篩查時,要考慮的不是能不能做,而是幾千上萬人訪問同一個數(shù)據(jù)庫時,如何解決高并發(fā)問題?!?/p>
同時,生物信息應用中有高計算量的需求,“在測序完成后,怎么樣分析所有數(shù)據(jù),給出相應報告,這在IT中需要高I/O、大內存和高CPU,這些不是單獨存在的,是在整個數(shù)據(jù)處理中被反復調用。”
所以陳杰認為,“生物信息云是一個繁雜的應用,集成了大部分行業(yè)云的特點,也有自己的特殊需求”。當然它與金融云等的共性是安全:金融要保障財產安全,生物信息則是生命數(shù)據(jù)和隱私的安全。
高性能計算則是生物信息云平臺的技術支撐。
華點云技術總監(jiān)于偉文告訴雷鋒網,高性能分成兩塊:一是隨著測序成本下降和數(shù)據(jù)增多,如何對數(shù)據(jù)解讀;二是面向臨床,怎么快速給到醫(yī)生報告。
他認為,傳統(tǒng)分析方法慢則幾天,面向臨床肯定不行。所以在技術上,針對不同的數(shù)據(jù)類型,以及同樣數(shù)據(jù)類型的不同數(shù)據(jù)量,他們會使用混合計算模式。他們會收集所有相關的已有生物信息計算算法,并進行比較,針對不同的領域找出最適合的算法。
于偉文稱,公司開發(fā)的乳腺癌檢測產品,用傳統(tǒng)方式分析100個樣本要四小時,而現(xiàn)在僅需5分鐘。據(jù)稱,嘉寶仁和的無創(chuàng)產檢服務,所有流程都在華點云的服務上實現(xiàn)。而阿里云對他們的評價是:第一家有能力將基因分析應用,落地在阿里云的EMR產品上的生物公司。
雖然現(xiàn)在華大基因也有提供BGIonline數(shù)據(jù)分析云平臺,不過在陳杰看來,從競爭本身看,目前的生物信息服務還不到需要談競爭策略,才能活下來的地步。
他推測,“整個應用市場100個華大基因也未必能支撐起來,還有更多應用產品和技術轉化的空間”。從華大出來的他認為,不妨說華大作為探索者做了一些市場預熱工作。
他告訴雷鋒網,整個基因檢測行業(yè)還處于進入期到成長期的轉型階段,還有更多的公司在注冊成立。一個市場成熟的標志,是要看行業(yè)里有沒有相應的標準,有沒有相應的政策,有沒有對于一些公司的調控與支撐。至少目前看來,行業(yè)沒有形成統(tǒng)一的標準,不是一個成熟的市場。
另外,基于基因檢測的產品本身還不成熟,沒有形成有影響力的產品與服務?,F(xiàn)在較為成熟的無創(chuàng)產前檢測NIPT,也只是針對產前檢查,屬于醫(yī)院某個科室的某個應用而已。
目前,華點云通過支撐為醫(yī)療和健康管理機構做基因檢測服務的企業(yè),提供所需要的生物信息技術,把服務規(guī)?;?,在這一過程中收取技術服務費。就像他們與嘉寶仁和的合作方式一樣。陳杰表示,實際上在整個領域里面,關于盈利模式的問題也都在探討與嘗試。
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