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百圖生科發(fā)布新型藥物「免疫機(jī)器人」,CEO劉維:制藥不是零和游戲

本文作者: 喬燕薇 2022-09-17 15:38
導(dǎo)語(yǔ):在劉維看來,百圖生科的免疫機(jī)器人,就像是SpaceX造新型可回收火箭,實(shí)現(xiàn)的功能與傳統(tǒng)藥物也完全不同。

“制藥行業(yè)并不是零和游戲?!?br/>

9月9日,百圖生科北京中心實(shí)驗(yàn)室落成暨免疫機(jī)器人發(fā)布戰(zhàn)略溝通會(huì)在京舉辦。

在溝通會(huì)上,百圖生科CEO劉維回答雷峰網(wǎng)提問時(shí)表示,“相反,創(chuàng)新藥企和主流藥企是合作關(guān)系?!?/span>

作為由百度創(chuàng)始人李彥宏、百度副總裁劉維發(fā)起成立的一家企業(yè),百圖生科出身自帶光環(huán)。

然而,百圖生科也不可避免地被貼上“百度系”的標(biāo)簽。但劉維向雷峰網(wǎng)(公眾號(hào):雷峰網(wǎng))介紹,百圖生科獨(dú)立于百度系之外,是一家創(chuàng)新藥企,而非互聯(lián)網(wǎng)公司。

值得注意的是,作為“造藥新勢(shì)力”的百圖生科,在成立近2年之后終于對(duì)外詳細(xì)闡述了其造藥思路。

據(jù)雷峰網(wǎng)了解,2021年,百圖生科與海淀區(qū)政府達(dá)成戰(zhàn)略合作,在海國(guó)投貝倫產(chǎn)業(yè)園區(qū)建設(shè)5000平米的百圖生科北京中心實(shí)驗(yàn)室。

這也是百圖生科自蘇州工業(yè)園區(qū)研發(fā)中心6000平米實(shí)驗(yàn)室之后,建設(shè)的又一個(gè)大型研發(fā)中心。

會(huì)上,百圖生科發(fā)布了自主研發(fā)的免疫機(jī)器人產(chǎn)品“ImmuBot”。這是一種通過生物計(jì)算引擎de novo設(shè)計(jì)的全新蛋白質(zhì)藥物。

據(jù)劉維介紹,它可以實(shí)現(xiàn)傳統(tǒng)抗體藥物無法實(shí)現(xiàn)的復(fù)雜作用機(jī)制,從而為大量未被滿足的臨床需求提供新的解決方案。

百圖生科發(fā)布新型藥物「免疫機(jī)器人」,CEO劉維:制藥不是零和游戲

在此前的媒體溝通會(huì)上,劉維就曾對(duì)ImmuBot免疫機(jī)器人下過定義——它既是一個(gè)平臺(tái),也是一種藥物。

他表示,“每種藥物都是一個(gè)免疫機(jī)器人,進(jìn)入人體后碰到不同的靶點(diǎn)能夠發(fā)揮不同的功能,同時(shí),各種不同的免疫機(jī)器人藥物都是基于這一技術(shù)完成,相當(dāng)于是一個(gè)研發(fā)平臺(tái)。

我們希望作為一個(gè)造藥新勢(shì)力尋求架構(gòu)級(jí)的變革,通過整合、利用新技術(shù),為患者帶來新的希望。”

百圖生科的自我定位

作為具有18年前沿技術(shù)風(fēng)險(xiǎn)投資經(jīng)驗(yàn)的資深A(yù)I投資人,劉維自2011年起系統(tǒng)布局人工智能底層技術(shù)和行業(yè)應(yīng)用,天使投資了曠視科技等上百家中美AI企業(yè)。

從2014年起,劉維即開始布局生物數(shù)據(jù)和計(jì)算產(chǎn)業(yè),并在2017年擔(dān)任BV百度風(fēng)投CEO開始,將生物計(jì)算作為BV的核心布局方向,在中美歐各地早期投資了40余家生物計(jì)算企業(yè),涵蓋了3D病理、納米孔測(cè)序、單細(xì)胞測(cè)序、CRISPR、腦機(jī)接口等諸多前沿技術(shù)。

通過多年來投資前沿技術(shù)公司的經(jīng)歷,劉維發(fā)現(xiàn),主流藥廠的藥物研發(fā)流程不一定能發(fā)揮這些技術(shù)的最大價(jià)值。

“雖然有了前沿的技術(shù),但如果我們作為CRO把這些技術(shù)賣給藥企,藥企不一定會(huì)做那么先進(jìn)的藥物研發(fā),生物計(jì)算等技術(shù)也很難觸達(dá)到藥企原有的藥物研發(fā)流程中。”

這是涉及到企業(yè)定位的問題,也是百圖生科決定自己做藥的邏輯所在。

換言之,百圖生科要走的,是一條和主流藥企完全不同的研發(fā)道路——生物計(jì)算驅(qū)動(dòng)的藥物研發(fā)。

而百圖生科做的創(chuàng)新藥物并非是單個(gè)的藥物,而是平臺(tái)化的藥物,由此產(chǎn)生的藥物研發(fā)組合多達(dá)幾十、上百個(gè),能夠?qū)崿F(xiàn)更高的價(jià)值。

然而,國(guó)際知名藥企都是“百年老店”,從研發(fā)經(jīng)驗(yàn)和團(tuán)隊(duì)建設(shè)等諸多方面,已經(jīng)形成了成熟的模式。

作為一家成立近2年的公司,百圖生科靠什么來做藥?答案是AI。

從2016年以來,以深度學(xué)習(xí)為代表的AI,已經(jīng)充分證明了自身在醫(yī)療領(lǐng)域的潛力。Alphafold的出現(xiàn),也讓生物學(xué)家更愿意接受計(jì)算機(jī)和理論的研究方法。

然而,先進(jìn)的AI技術(shù)應(yīng)用到藥物研發(fā)鏈條上也存在很高的門檻:不論是數(shù)據(jù)的獲取,還是數(shù)據(jù)計(jì)算與分析,都需要投入大量的成本。

長(zhǎng)期以來,高昂的生物實(shí)驗(yàn)費(fèi)用、漫長(zhǎng)的試驗(yàn)周期以及數(shù)目龐大的數(shù)據(jù)計(jì)算量一直是企業(yè)進(jìn)行AI制藥過程中的阻礙。

對(duì)主流藥企來說,這條路意味著不成正比的風(fēng)險(xiǎn)與收益。

因此,百圖生科要做的,是試圖將互聯(lián)網(wǎng)行業(yè)快速迭代、快速循環(huán)的組織方法和系統(tǒng)工程能力,以及AI模型快速迭代的能力融合進(jìn)生物制藥當(dāng)中,加速探索未知世界的過程。

過去十余年來,基礎(chǔ)的半導(dǎo)體、新材料等行業(yè)的快速發(fā)展,使生物行業(yè)出現(xiàn)了許多經(jīng)過單點(diǎn)驗(yàn)證的先進(jìn)技術(shù),這正是百圖生科切入這項(xiàng)業(yè)務(wù)的時(shí)機(jī)。

在劉維看來,這些單點(diǎn)技術(shù)很多都已成熟,但還缺乏一個(gè)真正的整合者。

“我們整體的定位還是做藥物的early discovery。百圖生科參與完成藥物的早期研發(fā)后,當(dāng)進(jìn)入臨床申報(bào)階段時(shí),就會(huì)將藥物授權(quán)給其他企業(yè),與國(guó)內(nèi)外大型藥廠的臨床、市場(chǎng)渠道優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)?!?/span>

這并不是一件容易的工作,制藥是一個(gè)系統(tǒng)性的工程,從靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)到藥物設(shè)計(jì)的全鏈條,要圍繞前沿的生物技術(shù)、數(shù)據(jù)技術(shù)、計(jì)算技術(shù)整合起來,“這是一個(gè)十項(xiàng)全能的游戲”。

為了實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo),過去一年中劉維組建起了強(qiáng)大的研發(fā)團(tuán)隊(duì),成員中包括十余位中國(guó)科學(xué)院、中國(guó)工程院、美國(guó)工程院的院士或者會(huì)士,以及近一百名博士出身的科學(xué)家。

團(tuán)隊(duì)成員參與過一百余種新藥物的研發(fā),發(fā)表過兩千余篇高質(zhì)量論文。

除了自身在產(chǎn)業(yè)鏈中的定位,百圖生科還做了一件重要的事情:確定一個(gè)具體的發(fā)力方向——免疫性疾病。

從建“朋友圈”到聚焦免疫疾病

本次發(fā)布會(huì)上,免疫機(jī)器人“ImmuBot”不是一個(gè)倉(cāng)促上馬的項(xiàng)目。早在其2021年5月主辦的首屆中國(guó)生物計(jì)算大會(huì)上,百圖生科就發(fā)布了“免疫圖譜卓越計(jì)劃”。

會(huì)上,百圖生科宣布將與合作伙伴共同開發(fā)免疫圖譜,為生物計(jì)算行業(yè)生態(tài)搭建基礎(chǔ)設(shè)施。

彼時(shí)百圖生科就已經(jīng)規(guī)劃,依托自身生物計(jì)算平臺(tái)和新藥發(fā)現(xiàn)能力,通過技術(shù)+投資,與主流藥廠和創(chuàng)新藥廠進(jìn)行合作,共同開發(fā)新藥。

百圖生科的投資版圖覆蓋國(guó)內(nèi)外多家生物制藥企業(yè),如Abintus Bio、Atomwise、百奧智匯、宸安生物等。

百圖生科發(fā)布新型藥物「免疫機(jī)器人」,CEO劉維:制藥不是零和游戲

百圖生科生態(tài)投資版圖

從患病群體看,全球范圍內(nèi)免疫系統(tǒng)疾病患者人數(shù)超10億。

其中有數(shù)千萬的腫瘤患者,由于免疫系統(tǒng)無法有效激活,導(dǎo)致腫瘤疾病發(fā)生發(fā)展和加速;還有數(shù)億名自身免疫性患者,由于免疫細(xì)胞錯(cuò)誤地攻擊人體正常組織,深受潰瘍性結(jié)腸炎、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、1型糖尿病等疾病困擾。

這是一個(gè)龐大的市場(chǎng)。在國(guó)內(nèi),2020年僅系統(tǒng)性紅斑狼瘡和類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎患者分別高達(dá)103萬人和600萬人。

預(yù)計(jì)國(guó)內(nèi)自身免疫性疾病2025年整體市場(chǎng)規(guī)模將達(dá)到87億美元,2030年市場(chǎng)規(guī)模將達(dá)到247億美元。

“這個(gè)市場(chǎng)本質(zhì)上是同一種作用機(jī)制,即都是由于人體免疫系統(tǒng)的失調(diào)?!眲⒕S介紹,“這也是過去十年間腫瘤免疫治療快速發(fā)展,PD1類藥物產(chǎn)生非常好的市場(chǎng)效應(yīng)的原因?!?/span>

目前的抗體藥物多是以單一或者兩三個(gè)靶點(diǎn),在全身范圍內(nèi)尋找細(xì)胞上的蛋白,讓藥物與蛋白做親和,以簡(jiǎn)單的抗體機(jī)理為主。

然而,由于人體免疫系統(tǒng)的復(fù)雜性,僅靠單一靶點(diǎn)的調(diào)控通常難以治愈疾病。

“在免疫治療這一整個(gè)非常有前景的市場(chǎng)中,藥物的實(shí)際有效性并不足1%,很多患者無藥可用,或者只是延長(zhǎng)幾個(gè)月的生命,就會(huì)產(chǎn)生耐藥性?!?/span>

人體的免疫系統(tǒng)中包含數(shù)十種免疫細(xì)胞,在不同的微環(huán)境中會(huì)表現(xiàn)出不同的狀態(tài),每個(gè)免疫細(xì)胞含有上萬種不同的蛋白質(zhì),其復(fù)雜的變化與相互作用關(guān)系共同構(gòu)成了免疫細(xì)胞的功能,進(jìn)而決定了免疫系統(tǒng)的功能。

所以,“當(dāng)我們談到解碼免疫時(shí),面臨著上萬億種復(fù)雜空間。百圖生科要做的,就是破譯這一復(fù)雜場(chǎng)景?!?/span>

AI制藥的核心是數(shù)據(jù)

如上文所言,數(shù)據(jù)是AI研究的核心。致力于免疫系統(tǒng)疾病藥物研發(fā)的百圖生科如何解決數(shù)據(jù)問題?

劉維稱,這是一個(gè)“悖論”,更早進(jìn)入藥企視線的小分子藥物雖然積累了更多的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),但建立在他人數(shù)據(jù)上的藥物研發(fā),進(jìn)入市場(chǎng)后其競(jìng)爭(zhēng)力與患者價(jià)值將非常有限;做創(chuàng)新藥物,則要面臨沒有數(shù)據(jù)的問題。

百圖生科選擇了第二條路。

為了解決數(shù)據(jù)難題,百圖生科成立以來花費(fèi)了大量精力,為數(shù)據(jù)的采集與處理做準(zhǔn)備。

百圖生科發(fā)布新型藥物「免疫機(jī)器人」,CEO劉維:制藥不是零和游戲

百圖生科實(shí)驗(yàn)室自有設(shè)備拍攝的高內(nèi)涵細(xì)胞視覺數(shù)據(jù)

首先,百圖生科引入新的多組學(xué)生物數(shù)據(jù)的采集手段,獲取數(shù)量更多、更加精準(zhǔn)的數(shù)據(jù)。

例如在靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域使用單細(xì)胞技術(shù)、在蛋白質(zhì)領(lǐng)域使用各種高分辨率的蛋白觀測(cè)和性質(zhì)測(cè)定技術(shù)、通過基因編輯技術(shù)對(duì)細(xì)胞進(jìn)行擾動(dòng)以產(chǎn)生更精細(xì)化的數(shù)據(jù)。

其次,百圖生科引入新型生物專家,確保應(yīng)用的新生物技術(shù)正常產(chǎn)生與處理數(shù)據(jù)。

第三,百圖生科通過新技術(shù)的應(yīng)用與改造,對(duì)多根數(shù)據(jù)軸所產(chǎn)生的數(shù)據(jù)進(jìn)行疊加和驗(yàn)證。

在百圖生科的免疫模擬系統(tǒng)中,不僅使用傳統(tǒng)的生物的手段去測(cè)免疫細(xì)胞,同時(shí)還引入了機(jī)器視覺的方法對(duì)免疫細(xì)胞進(jìn)行觀測(cè),通過多種疊加的生物傳感的手段,來獲得更精準(zhǔn)的生物數(shù)據(jù)。

最新的北京中心實(shí)驗(yàn)室落成以后,百圖生科已經(jīng)在北京、蘇州、硅谷建立了三個(gè)研發(fā)中心和上萬平米的高通量實(shí)驗(yàn)室。

“我們做的是在世界上、在生物領(lǐng)域首創(chuàng)的大規(guī)模人體類免疫系統(tǒng)或器官,具有非常大的領(lǐng)先性?!眲⒕S介紹,百圖生科通過大量先進(jìn)的生物技術(shù)實(shí)現(xiàn)在體外對(duì)于人體免疫系統(tǒng)的復(fù)制。

利用基因編輯技術(shù)對(duì)人體免疫細(xì)胞進(jìn)行編輯,將多種免疫細(xì)胞混合,模擬人體免疫系統(tǒng)的情況,形成高通量人體免疫模擬實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)。

該系統(tǒng)產(chǎn)生的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)是百圖生科高通量干濕閉環(huán)實(shí)驗(yàn)的核心。

“生物計(jì)算的核心不僅是要?jiǎng)?chuàng)造新的生物數(shù)據(jù),還要用計(jì)算將這些生物數(shù)據(jù)利用好。”劉維介紹。

利用生物計(jì)算引擎,百圖生科將藥物研發(fā)的傳統(tǒng)流程進(jìn)行了優(yōu)化,大部分的研發(fā)步驟通過AI引擎在虛擬空間內(nèi)進(jìn)行,提高研發(fā)效率。

高通量試驗(yàn)系統(tǒng)做藥物研發(fā),首先要進(jìn)行干實(shí)驗(yàn),通過空間設(shè)計(jì)研發(fā)出免疫機(jī)器人的彈頭、傳感器等構(gòu)件,選定免疫機(jī)器人構(gòu)型,將構(gòu)件與免疫機(jī)器人進(jìn)行不同組合,形成多種免疫機(jī)器人藥物。

在濕實(shí)驗(yàn)環(huán)節(jié),通過生物計(jì)算引擎對(duì)組合出的候選免疫機(jī)器人進(jìn)行藥物功能、藥物可開發(fā)性等多參數(shù)評(píng)估,從中篩選出成功率最高的免疫機(jī)器人,再以蛋白打印的方式將這一虛擬預(yù)測(cè)的序列變成實(shí)體蛋白,回到實(shí)驗(yàn)室中進(jìn)行高通量實(shí)驗(yàn),通過多個(gè)輪次的循環(huán),最終選出拼接最好的免疫機(jī)器人藥物。

以百圖生科目前的技術(shù)能力,可以支撐數(shù)十個(gè)藥物研發(fā)項(xiàng)目同時(shí)進(jìn)行。

按照劉維預(yù)期,百圖生科北京中心實(shí)驗(yàn)室未來每年將產(chǎn)生上億組數(shù)據(jù),為高通量干濕閉環(huán)提供重要回路。

用大科學(xué)裝置建模免疫系統(tǒng)

解決數(shù)據(jù)難題后,百圖生科的藥物研發(fā)工作日趨完善。那么如何理解這次發(fā)布的免疫機(jī)器人?

劉維將免疫機(jī)器人比喻為樂高積木,具體而言,把已預(yù)置好的免疫調(diào)控彈頭、傳感器、控制器、不同功能的“底座”等進(jìn)行構(gòu)件組裝,嘗試通過多構(gòu)件開發(fā)、多構(gòu)件復(fù)用的方式,降低藥物開發(fā)成本,平衡精準(zhǔn)藥物與開發(fā)成本間的矛盾,為小病種免疫疾病帶去更多可能。

百圖生科希望通過免疫機(jī)器人創(chuàng)新藥物重編免疫系統(tǒng),治愈那些令現(xiàn)有抗體藥或小分子藥物束手無策的免疫系統(tǒng)疾病。

當(dāng)lmmuBot免疫機(jī)器人進(jìn)入人體后,所攜帶的藥物構(gòu)建在遇到不同的對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)時(shí)將分別發(fā)揮作用,可以進(jìn)行精準(zhǔn)調(diào)控。

這款藥物具有四個(gè)典型特點(diǎn)。

首先,其藥物彈頭具有突出的高性能。

人體內(nèi)的蛋白質(zhì)具有多種不同形態(tài)以及不同的可結(jié)合表位,藥物在以不同方式與同一個(gè)靶點(diǎn)結(jié)合時(shí)會(huì)觸發(fā)不同的功能,藥物彈頭不但能與目標(biāo)靶點(diǎn)結(jié)合,并且能夠精準(zhǔn)有效地調(diào)控靶點(diǎn)及其發(fā)揮的功能。

其次,lmmuBot免疫機(jī)器人是一款組合多靶向的藥物。

在疾病治療過程中,僅僅用少數(shù)幾個(gè)靶點(diǎn)區(qū)分疾病組織與非疾病組織或是調(diào)控免疫系統(tǒng)時(shí),其準(zhǔn)確性往往不足,而lmmuBot免疫機(jī)器人目前每款藥物能夠兼容四個(gè)、六個(gè)或八個(gè)以及更多數(shù)量的靶點(diǎn),未來將擴(kuò)展至兼容數(shù)十個(gè)不同靶點(diǎn)。

通過數(shù)十個(gè)靶點(diǎn)組合使藥物具有更加精準(zhǔn)的特異性和有效性,覆蓋與免疫系統(tǒng)疾病相關(guān)的大部分靶點(diǎn)。

第三,lmmuBot免疫機(jī)器人是編程式控制。

目前的蛋白質(zhì)、抗體類藥物具有一定的精準(zhǔn)性,進(jìn)入人體后針對(duì)相應(yīng)的某個(gè)靶點(diǎn)進(jìn)行作用,但這樣的程度對(duì)于疾病治療來說遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。

通過機(jī)器人技術(shù)平臺(tái),lmmuBot免疫機(jī)器人實(shí)現(xiàn)了更復(fù)雜的編程式控制。

人體內(nèi)的靶點(diǎn)在疾病微環(huán)境或腫瘤微環(huán)境中時(shí),除蛋白質(zhì)外還存在某些特有的細(xì)胞因子和酶,機(jī)器人藥物通過傳感器感知和響應(yīng)這些靶點(diǎn)的特異性,遇到不同的靶點(diǎn)時(shí)激活不同藥物,兼容不同病人的病情。

第四,lmmuBot免疫機(jī)器人是構(gòu)件式組裝的藥物,通過組裝不同的藥物構(gòu)件完成不同的功能預(yù)置。

免疫機(jī)器人常用的特異性彈頭Seeker,能夠精準(zhǔn)地找到疾病特異性組織。按照功能設(shè)計(jì),激活不同免疫細(xì)胞的調(diào)控彈頭,或是多個(gè)免疫調(diào)控彈頭相組合,共同對(duì)不同的免疫細(xì)胞進(jìn)行功能調(diào)控。

“我們正在全力以赴地做一種突破創(chuàng)新性的藥物。”劉維打了個(gè)比方,“像SpaceX造新型可回收火箭一樣,它能夠?qū)崿F(xiàn)的功能與傳統(tǒng)的火箭不同,我們的ImmuBot與傳統(tǒng)的藥物也不盡相同,因此往往需要很新技術(shù)和很長(zhǎng)的研發(fā)周期?!?/span>

對(duì)于免疫機(jī)器人的研發(fā)和應(yīng)用,百圖生科的實(shí)現(xiàn)策略,劉維稱之為“百圖之道”。

百圖生科利用免疫機(jī)器人這一技術(shù)平臺(tái),構(gòu)建了一個(gè)大型的創(chuàng)新藥物資產(chǎn)組合“Denove Portfolio”,包含靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)、構(gòu)件倉(cāng)庫(kù)、藥物管線三個(gè)環(huán)節(jié)。

在“Denove Portfolio”的背后,是百圖生科的構(gòu)建的AI大模型驅(qū)動(dòng)的生物計(jì)算引擎。

而大模型的燃料,正是百圖生科通過收集、加工以及與臨床機(jī)構(gòu)、藥企合作產(chǎn)生的數(shù)據(jù),構(gòu)建出的上萬億關(guān)系的多組學(xué)免疫圖譜。

百圖生科利用AI大模型消化大量數(shù)據(jù),推演人體免疫系統(tǒng)的運(yùn)作規(guī)律,并通過實(shí)驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證,從而對(duì)免疫系統(tǒng)進(jìn)行大規(guī)模精準(zhǔn)建模,找到復(fù)雜的靶點(diǎn)規(guī)律。

生物計(jì)算引擎的負(fù)責(zé)人、百圖生科首席AI科學(xué)家宋樂在溝通會(huì)上介紹,這一體系的核心是千億級(jí)大規(guī)模的生物預(yù)訓(xùn)練模型——xTrimo免疫大腦,“不但能夠精細(xì)化整理免疫知識(shí)圖譜中的信息,還可以與高通量閉環(huán)進(jìn)行交互迭代提升模型?!?/span>

宋樂介紹,生物計(jì)算領(lǐng)域有蛋白質(zhì)單序列、蛋白質(zhì)相互作用、細(xì)胞層面、細(xì)胞系統(tǒng)層面四層不同的信息,而該訓(xùn)練模型內(nèi)部同樣具有四層嵌套大規(guī)模訓(xùn)練模型體系。

百圖生科發(fā)布新型藥物「免疫機(jī)器人」,CEO劉維:制藥不是零和游戲

百圖生科首席AI科學(xué)家宋樂

最內(nèi)層的模型吸收蛋白質(zhì)序列信息,對(duì)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)、性質(zhì)進(jìn)行預(yù)測(cè);

第二層模型吸收蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)與其他分子之間相互作用的數(shù)據(jù),進(jìn)行蛋白質(zhì)相互作用復(fù)合物結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、抗體抗原結(jié)合表位預(yù)測(cè)以及結(jié)合的親和力預(yù)測(cè)等問題;

第三層是更大尺度的細(xì)胞層面的建模,同時(shí)考慮蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)對(duì)基因表達(dá)調(diào)控的功能關(guān)系,預(yù)測(cè)細(xì)胞在擾動(dòng)以及組合擾動(dòng)的情況下發(fā)生的變化;

在單個(gè)細(xì)胞建模之上,最外層模型要考慮復(fù)雜的免疫系統(tǒng)以及免疫系統(tǒng)和腫瘤或其他環(huán)境的相互作用,需要引入大量細(xì)胞之間的相互通信、細(xì)胞和環(huán)境之間相互作用的數(shù)據(jù),從而更好地預(yù)測(cè)免疫系統(tǒng)對(duì)擾動(dòng)的響應(yīng)。

這也正是生物計(jì)算的特殊之處。

互聯(lián)網(wǎng)大規(guī)模訓(xùn)練模型通常是自然語(yǔ)言模型,而生物計(jì)算模型的四層系統(tǒng)是嵌套體系,預(yù)測(cè)出的結(jié)果可以嵌套使用,下層的預(yù)測(cè)和產(chǎn)生的表征可以幫助提升上層模型的預(yù)測(cè)。

在免疫機(jī)器人技術(shù)平臺(tái)、生物計(jì)算引擎等的支撐下,百圖生科的創(chuàng)新藥物資產(chǎn)組合“Denove Portfolio”版圖不斷擴(kuò)大。

據(jù)介紹,目前百圖生科已有十余個(gè)靶點(diǎn)挖掘項(xiàng)目、三十余個(gè)構(gòu)件項(xiàng)目、十余個(gè)藥物研發(fā)項(xiàng)目正在進(jìn)行,其中包含中國(guó)高發(fā)的胃癌、肝癌、結(jié)直腸癌等多個(gè)病種組織的特異性彈頭,以實(shí)現(xiàn)更精準(zhǔn)的靶向治療。

此外,百圖生科還研發(fā)了近十種創(chuàng)新的免疫細(xì)胞彈頭,除常見的T細(xì)胞品類之外,還有大量的NK等比較有特點(diǎn)的免疫細(xì)胞。

利用開發(fā)者平臺(tái),百圖生科與國(guó)內(nèi)外的多家大中型藥企聯(lián)合開發(fā)了多款疾病品種藥物。

劉維總結(jié),百圖生科在做的,就是“用大科學(xué)裝置建模免疫系統(tǒng),de novo設(shè)計(jì)全新的蛋白質(zhì)藥物”。

“百圖生科的大科學(xué)裝置,不僅能夠服務(wù)于自身的模型訓(xùn)練,我們也希望它能夠作為一個(gè)平臺(tái),為行業(yè)中眾多藥物研發(fā)伙伴提供幫助?!?/span>

如今,百圖生科已經(jīng)構(gòu)建起大規(guī)模創(chuàng)新藥物組合,背后依托大規(guī)模AI生物計(jì)算引擎和卓越開發(fā)者生態(tài)平臺(tái),“我們希望這些東西聯(lián)合起來,能夠變革first in class藥物研發(fā)模式。”

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