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本文作者: 喬燕薇 | 2022-10-21 11:48 |
近日,2022年醫(yī)學(xué)人工智能大會(huì)(CMAI 2022)暨第二屆“中國(guó)醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)期刊發(fā)展”高端論壇召開(kāi)。
本次高峰論壇邀請(qǐng)了多位頂尖醫(yī)院的放射科主任及人工智能技術(shù)的權(quán)威專(zhuān)家,共同探討人工智能技術(shù)在醫(yī)學(xué)影像中的臨床應(yīng)用與科研進(jìn)展,分享研究心得。
雷峰網(wǎng)《醫(yī)健AI掘金志》作為本次大會(huì)的支持單位,全程參與嘉賓的演講內(nèi)容與深度報(bào)道。
首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院副院長(zhǎng)盧潔教授作為本次大會(huì)的嘉賓,以《腦脫髓鞘病MRI成像的人工智能應(yīng)用研究》為題發(fā)表了演講。
以下是盧潔教授的演講內(nèi)容,雷峰網(wǎng)(公眾號(hào):雷峰網(wǎng))《醫(yī)健AI掘金志》進(jìn)行了不改變?cè)獾恼怼?/p>
大家好,今天向大家匯報(bào)的主題是腦脫髓鞘病磁共振成像的人工智能應(yīng)用。
腦脫髓鞘病是以神經(jīng)髓鞘脫失為主要或始發(fā)病變,隨后出現(xiàn)軸索、胞體和神經(jīng)膠質(zhì)受損的神經(jīng)免疫疾病,主要包括多發(fā)性硬化(MS)和視神經(jīng)脊髓炎(NMO)。
全球約有280萬(wàn)多發(fā)性硬化患者,中國(guó)約有4.2萬(wàn)例,這也是中青年人群致殘的神經(jīng)系統(tǒng)常見(jiàn)疾病。
其病理性的特征改變是腦白質(zhì)多發(fā)性脫髓鞘斑塊伴反應(yīng)性膠質(zhì)增生和軸索損傷。疾病早期主要表現(xiàn)為髓鞘崩解與脫失和小膠質(zhì)細(xì)胞激活,軸索相對(duì)完好。病變晚期則表現(xiàn)為軸突崩解、神經(jīng)細(xì)胞減少并形成神經(jīng)膠質(zhì)的硬化斑。
這是2017版的多發(fā)性硬化診斷標(biāo)準(zhǔn),可以看到在診斷中我們既需要客觀的臨床證據(jù),也需要一些額外的證據(jù)。其中,磁共振成像是協(xié)助多發(fā)性硬化診斷的最重要的評(píng)估方法。
臨床中應(yīng)用的常規(guī)磁共振成像可以為多發(fā)性硬化提供多維度的信息,包括病灶數(shù)量、位置、體積,以及強(qiáng)化的特點(diǎn)和病灶進(jìn)程。而且,常規(guī)磁共振診斷多發(fā)性硬化的靈敏度較高,可達(dá)到約95%。
多發(fā)性硬化病灶的常見(jiàn)位置為側(cè)腦室周?chē)?、皮層下、u型纖維、腦干和小腦,形態(tài)呈橢圓形或手指狀。急性期病灶有膨脹感,呈現(xiàn)“煎蛋征”、“開(kāi)環(huán)狀”、“C型”強(qiáng)化,強(qiáng)化持續(xù)時(shí)間在90天以?xún)?nèi)。在慢性期T1呈現(xiàn)低信號(hào)病灶,呈“黑洞”狀。
這是多發(fā)性硬化病灶在腦內(nèi)的典型分布位置,側(cè)腦室旁、幕下以及胼胝體。
典型表現(xiàn)為u形纖維病灶、Dawson手指征以及卵圓形的病灶形態(tài)。
不同時(shí)期的病灶特點(diǎn)也不相同,在時(shí)間上呈現(xiàn)多相性。如果對(duì)病人進(jìn)行臨床隨訪,可能會(huì)發(fā)現(xiàn)患者出現(xiàn)新發(fā)病灶,且病灶往往在一個(gè)以上,同時(shí)存在強(qiáng)化病灶與不強(qiáng)化病灶,也就是說(shuō)既有急性期病灶也有慢性期病灶。
視神經(jīng)脊髓炎也是中樞神經(jīng)系統(tǒng)常見(jiàn)的炎性脫髓鞘疾病,發(fā)病率僅次于多發(fā)性硬化,在亞洲更加多見(jiàn),尤其以女性多發(fā),男女比例大約是1:4。該病主要累及視神經(jīng)、脊髓、腦,血清特異性自身抗體為AQP4抗體陽(yáng)性。85%-90%患者會(huì)復(fù)發(fā),預(yù)后比多發(fā)性硬化更差。
視神經(jīng)脊髓炎的診斷標(biāo)準(zhǔn)多年來(lái)經(jīng)歷了數(shù)次演變,1894年首次提出NMO的概念;1999年出現(xiàn)第一個(gè)NMO診斷標(biāo)準(zhǔn);2004年AQP4-lgG發(fā)現(xiàn)后,NMO被認(rèn)為是不同于MS的獨(dú)立疾??;2007年提出了NMOSD(視神經(jīng)脊髓炎譜系疾?。┑男赂拍?;2015年出現(xiàn)了最新的NMOSD診斷共識(shí)。
視神經(jīng)脊髓炎譜系疾病可以根據(jù)AQP4抗體陰性與AQP4抗體陽(yáng)性來(lái)進(jìn)行診斷,磁共振評(píng)估是診斷中的重要環(huán)節(jié)。
NMOSD的腦內(nèi)病灶并不少見(jiàn),43%-70%的患者首次發(fā)病即可出現(xiàn)腦內(nèi)病灶,主要包括圍繞腦室系統(tǒng)的室管膜周?chē)≡?、?cè)腦室周?chē)半蓦阵w病灶、皮質(zhì)脊髓束病灶、半球白質(zhì)病灶以及非特異性病灶。
這是NMOSD間腦和大腦損害的MRI改變,通常為丘腦及下丘腦損傷,廣泛的皮質(zhì)下白質(zhì)損害及強(qiáng)化;E是沿胼胝體長(zhǎng)軸的線樣損害,F(xiàn)是沿大腦腳、橋腦皮質(zhì)脊髓束縱向損害,以及急性室管膜周大腦白質(zhì)損害及強(qiáng)化的改變。
此外我們還可以看到NMOSD延髓背側(cè)、極后區(qū)及腦干受損的磁共振表現(xiàn),表現(xiàn)為延髓背側(cè)病灶、極后區(qū)病灶、四腦室周?chē)皹蚰X腹側(cè)損害、中腦背側(cè)損害以及四腦室周?chē)鷵p害。
NMOSD的特征性病灶為室管膜周?chē)≡钜约捌べ|(zhì)脊髓束病灶。
這是NMO的側(cè)腦室周?chē)半蓦阵w病灶,側(cè)腦室旁病變緊貼著側(cè)腦室壁,沿管膜內(nèi)襯分布,常見(jiàn)于側(cè)腦室前后腳周?chē)?,不常累及?cè)腦室體周?chē).?dāng)累及胼胝體全層時(shí),病灶呈現(xiàn)“拱橋樣”改變,而胼胝體-透明隔交界處(CSI)的腦部病灶則更常見(jiàn)于MS。
半球白質(zhì)病灶可表現(xiàn)為腫瘤樣脫髓鞘病變、多發(fā)性硬化樣病變以及急性播散性腦脊髓炎樣病變。
MS與NMOSD的鑒別診斷十分具有挑戰(zhàn)性,根據(jù)既往文獻(xiàn)的報(bào)道,大約30%的MS患者在疾病早期會(huì)被誤診為NMOSD。這兩種疾病的臨床癥候比較相似,實(shí)驗(yàn)室檢查結(jié)果也有部分重疊,因此確診周期較長(zhǎng),大約12%的患者需要至少6年時(shí)間才能確診。對(duì)基層醫(yī)院的醫(yī)生與低年資醫(yī)生來(lái)說(shuō),這兩種疾病的診斷更具有挑戰(zhàn)性。
人工智能是不是能幫助我們來(lái)做一些工作呢?人工智能是利用計(jì)算機(jī)技術(shù)模擬人類(lèi)的思維和學(xué)習(xí)過(guò)程,使之勝任人類(lèi)智能才可完成的復(fù)雜工作。它的發(fā)展從1950年,計(jì)算機(jī)和人類(lèi)智能的交互開(kāi)始,再到1980年機(jī)器學(xué)習(xí)的算法改進(jìn),使我們能夠進(jìn)行大數(shù)據(jù)處理,再到2010年深度學(xué)習(xí)中的智能神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)解碼更深層次的影像信息。
影像組學(xué)是在大數(shù)據(jù)和人工智能的背景下產(chǎn)生的精準(zhǔn)影像分析技術(shù),能挖掘肉眼無(wú)法識(shí)別的高維定量特征。運(yùn)用高級(jí)數(shù)學(xué)模型算法轉(zhuǎn)化為具有高分辨率可重復(fù)、低冗余可挖掘的高維數(shù)據(jù),對(duì)特征進(jìn)行量化分析,從而深入探討圖像中包含的潛在信息。
這是具體的影像組學(xué)工作流程圖,從圖像采集與分割,到深度特征、語(yǔ)義特征、形態(tài)特征及紋理特征的提取,再到進(jìn)行特征篩選與模型構(gòu)建。特征篩選和建模均有很多方法可供選擇。
我們來(lái)看一下組學(xué)列線圖,它是建立在多因素回歸分析的基礎(chǔ)上,將多個(gè)預(yù)測(cè)指標(biāo)進(jìn)行整合,然后采用帶有刻度的線段,按照一定比例繪制在同一平面上,從而用來(lái)表達(dá)預(yù)測(cè)模型中各個(gè)變量之間的相互關(guān)系。
在腦脫髓鞘病MRI成像人工智能應(yīng)用研究中,我們收集到150例患者,其中73例為多發(fā)性硬化,77例為視神經(jīng)脊髓炎。我們以68例患者作為訓(xùn)練集,62例作為驗(yàn)證集,手動(dòng)勾畫(huà)病灶,基于組學(xué)列線圖在T2WI圖像的病灶中提取了273個(gè)定量組學(xué)特征。
最終篩選出11個(gè)組學(xué)特征和4個(gè)臨床特征,可以看到訓(xùn)練集AUC和測(cè)試集AUC是比較接近的。
另外一個(gè)課題對(duì)189例的患者進(jìn)行了研究,其中95例是多發(fā)性硬化,94例是視神經(jīng)脊髓炎,其中以135例患者作為訓(xùn)練集,54例作為驗(yàn)證集,手動(dòng)勾畫(huà)病灶之后,同樣基于組學(xué)列線圖,在頸髓T2WI圖像顯示的病灶中提取了485定量組學(xué)特征。
最終篩選出9個(gè)組學(xué)特征與5個(gè)臨床特征納入模型,其鑒別效能較高。
人工智能輔助鑒別診斷同樣具有挑戰(zhàn)性,主要在于基于單一的臨床數(shù)據(jù)庫(kù)、基于單一序列、基于單一磁共振儀,組學(xué)列線圖仍缺乏可解釋性,且缺乏人工智能模型和臨床醫(yī)生判讀的對(duì)比。
宣武醫(yī)院收集了116例腦脫髓鞘病患者,其中78例為MS,38例為NMO,包含兩個(gè)數(shù)據(jù)集,既有1.5T又有3T。我們收集了T1-MPRAGE和T2WI兩個(gè)序列的影像數(shù)據(jù),以及患者的殘疾程度評(píng)分、病程等臨床信息。
我們從T2病灶中提取了1118個(gè)定量的組學(xué)特征,基于多參數(shù)影像表征,構(gòu)建了隨機(jī)森林分類(lèi)模型,將篩選出的9個(gè)組學(xué)特征和4個(gè)臨床特征篩選出來(lái)納入模型。
并且對(duì)比了神經(jīng)影像醫(yī)生閱片診斷和影像組學(xué)模型診斷的正確率。醫(yī)生的鑒別結(jié)果準(zhǔn)確率為0.709,敏感性為0.615,特異性為0.750。機(jī)器學(xué)習(xí)模型鑒別結(jié)果的準(zhǔn)確率、敏感性、特異性都有明顯提高,優(yōu)于醫(yī)生肉眼鑒別的結(jié)果。
機(jī)器學(xué)習(xí)模型由高維的組學(xué)特征組成,所以其解釋性相對(duì)來(lái)說(shuō)比較差,不容易理解。SHAP是目前比較流行的一種模型解釋方法,通過(guò)計(jì)算在合作中每個(gè)個(gè)體的貢獻(xiàn)來(lái)確定個(gè)體的重要程度。本模型具有可解釋性,對(duì)于case A,隨機(jī)森林模型判斷有89%可能性是MS,其中最主要的貢獻(xiàn)來(lái)自H-MPR-Log_95這個(gè)特征,我們可以把每一個(gè)特征的貢獻(xiàn)值計(jì)算出來(lái)。
拓?fù)渚褪前褜?shí)體抽象成與其大小、形狀無(wú)關(guān)的“點(diǎn)”,而把連接實(shí)體的線路抽象成“線”,進(jìn)而以圖的形式來(lái)表示這些點(diǎn)與線之間關(guān)系的方法,目的在于研究這些點(diǎn)、線之間的相連關(guān)系。拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)圖就是表示點(diǎn)和線之間關(guān)系的圖,拓?fù)淇梢詰?yīng)用在分子結(jié)構(gòu)、地理圖、DNA結(jié)構(gòu)和繩結(jié)等。
我們也可以將拓?fù)湓谀X脫髓鞘疾病的診斷中進(jìn)行應(yīng)用。由于MS和NMO兩種疾病的發(fā)病機(jī)制不同,其腦內(nèi)病灶的空間分布不同,形態(tài)、大小也不相同,所以這兩種疾病的腦內(nèi)病灶的拓?fù)湫再|(zhì)并不相同,我們希望能夠找到潛在的鑒別診斷突破點(diǎn)。
我們對(duì)97例脫髓鞘病例的T2WI數(shù)據(jù)進(jìn)行了分析,其中66例MS,31例NMO。這部分?jǐn)?shù)據(jù)的結(jié)果我們目前還沒(méi)有發(fā)表。具體通過(guò)軟件勾畫(huà)病灶,提取MS多發(fā)病灶的空間模式。整個(gè)DTA的框架是由三個(gè)模塊組成的,動(dòng)態(tài)層次網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建、動(dòng)態(tài)拓?fù)淞炕约巴負(fù)淠J椒治觥?/p>
我們看到鑒別診斷的拓?fù)溲芯拷Y(jié)果,與MS患者腦內(nèi)病灶比較,NMO患者的病灶連接更加緊密,而且病灶的體積更大。拓?fù)溲芯烤哂泻芏鄡?yōu)點(diǎn),模型和結(jié)果可視化、病灶網(wǎng)絡(luò)連接可視化、病灶體積可視化。
和以往的鑒別診斷模型比較,拓?fù)淠P途哂懈叩腁UC,達(dá)到0.875,準(zhǔn)確性和特異性也很高。
以前的文獻(xiàn)報(bào)道中,MS磁共振預(yù)測(cè)研究的準(zhǔn)確率大約為58%~70%,其臨床表現(xiàn)和影像學(xué)的征象通常不匹配,磁共振的病灶缺乏特異性,T2WI和T1WI上病灶的病理特征也缺乏特異性。
所以我們是不是可以通過(guò)基于拓?fù)涞娜斯ぶ悄苣P蛠?lái)幫助預(yù)測(cè)預(yù)后。
通過(guò)磁共振縱向隨訪研究發(fā)現(xiàn),慢性病灶具有融合的趨勢(shì),而且臨床的殘疾程度會(huì)逐漸增加。所以我們提出假設(shè)隨著疾病的進(jìn)展,病灶的拓?fù)湫再|(zhì)發(fā)生改變;反之,病灶拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)變化也具有潛在的預(yù)測(cè)作用。
這部分研究共收集了90例進(jìn)展的MS和54例非進(jìn)展MS,如果殘疾量表增高1.5分以上就定義為進(jìn)展,小于1.5分定義為非進(jìn)展,用T2WI數(shù)據(jù)進(jìn)行訓(xùn)練。通過(guò)對(duì)病灶進(jìn)行勾畫(huà)提取多發(fā)病灶的空間模式。
結(jié)果顯示,和非進(jìn)展的患者相比,進(jìn)展的MS患者具有更密集的病灶連接,而且病灶的病變體積更大。同時(shí)也實(shí)現(xiàn)了模型及結(jié)果可視化、病灶3D可視化、病灶網(wǎng)絡(luò)連接可視化和病灶體積可視化。
和既往的研究報(bào)道相比,磁共振預(yù)測(cè)模型同樣顯示了更高的AUC,達(dá)到了0.752,準(zhǔn)確性、特異性也較高。
總結(jié)一下:
多發(fā)性硬化、視神經(jīng)脊髓炎是常見(jiàn)的腦脫髓鞘病,但是二者的鑒別診斷困難;而人工智能可以幫助挖掘影像圖像中肉眼無(wú)法識(shí)別的高維定量特征;基于拓?fù)涞娜斯ぶ悄苣P驮陬A(yù)測(cè)腦脫髓鞘病預(yù)后中具有重要的價(jià)值,未來(lái)我們也希望在這方面進(jìn)行更深入的探索。
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