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蛇?蝙蝠?水貂?新型冠狀病毒究竟來源于哪種動(dòng)物?

本文作者: 李菁瑛 2020-01-30 15:22
導(dǎo)語:這場(chǎng)突如其來的疫情,給我們的教訓(xùn),已經(jīng)足夠深刻了。

與往年相比,2020年的這個(gè)春節(jié),實(shí)在是太難了。

2019年的冬天,來自武漢的一種新型冠狀病毒悄然滋生,伴隨著春運(yùn)的“大遷徙”,迅速蔓延到了全國(guó)各地。

據(jù)國(guó)家衛(wèi)健委通報(bào),截至1月29日24時(shí),累計(jì)報(bào)告確診病例7711例,現(xiàn)有重癥病例1370例,累計(jì)死亡病例170例,累計(jì)治愈出院病例124例,共有疑似病例12167例。短短一個(gè)月時(shí)間,新型冠狀病毒肺炎疫情的確診病例已超過2003年的SARS疫情。

不斷上升的數(shù)字,牽動(dòng)著全國(guó)人民的心。疫情之下,除了要做好隔離和救治,找到“病毒源頭”也同樣重要。

盡快確認(rèn)病毒的源頭宿主和中間宿主,可以加快針對(duì)該病毒藥物與疫苗的研發(fā),迅速阻斷人與病原體的接觸,對(duì)于病毒病原體早期預(yù)防和疫情控制的意義,不言而喻。

新型冠狀病毒來源于“野味”

2020年1月7日,武漢肺炎病原體初步判定為新型冠狀病毒,經(jīng)測(cè)序,獲得其全基因組序列,隨后得到公布。

1月20日,國(guó)家衛(wèi)健委高級(jí)別專家組組長(zhǎng)、中國(guó)工程院院士鐘南山在采訪中表示,從各方面的流行病學(xué)的調(diào)查看,這次疫情的源頭來自一個(gè)野生動(dòng)物,比如說竹鼠、獾這類。

1月22日,中科院院士、中國(guó)疾病預(yù)防控制中心主任高福表示,此次新型冠狀病毒來自于武漢一家海鮮市場(chǎng)非法銷售的野生動(dòng)物。

經(jīng)過調(diào)查,專家很快鎖定了武漢華南海鮮市場(chǎng),雖以海鮮市場(chǎng)冠名,但其實(shí)際上卻是個(gè)綜合市場(chǎng)。據(jù)了解,這個(gè)市場(chǎng)存在多家野生動(dòng)物交易商鋪,也就是所謂的“野味”。

蛇?蝙蝠?水貂?新型冠狀病毒究竟來源于哪種動(dòng)物? 

1月26日,中國(guó)疾控中心病毒病所首次從華南海鮮市場(chǎng)的585份環(huán)境樣本中,檢測(cè)到33份樣品含有新型冠狀病毒核酸,并成功在陽性環(huán)境標(biāo)本中分離病毒,提示該病毒來源于華南海鮮市場(chǎng)銷售的野生動(dòng)物,但研究并未鎖定是哪一種具體的動(dòng)物。

新型冠狀病毒流行源自蛇?遭學(xué)界質(zhì)疑

據(jù)雷鋒網(wǎng)此前報(bào)道,1月22日,一篇發(fā)表在Journal of Medical Virology(醫(yī)學(xué)病毒雜志)的論文指出,與刺猬、穿山甲等其他動(dòng)物相比,2019-nCoV的密碼子使用偏好與蛇類似,因此蛇最有可能是攜帶新型冠狀病毒的動(dòng)物。

蛇?蝙蝠?水貂?新型冠狀病毒究竟來源于哪種動(dòng)物?

不過,這樣的消息很快得到了學(xué)界的質(zhì)疑:科學(xué)媒體“知識(shí)分子”商周專欄在23日發(fā)表文章稱,“此前流行的SARS和MERS病毒的自然宿主均是蝙蝠,通過果子貍和駱駝傳染給人,也就是說,病毒的傳遞是在哺乳動(dòng)物之間進(jìn)行的。但蛇不是哺乳動(dòng)物,而是爬行類。”

蛇?蝙蝠?水貂?新型冠狀病毒究竟來源于哪種動(dòng)物?

圣保羅大學(xué)的病毒學(xué)家Paulo EduardoBrand?o說:“他們沒有證據(jù)表明蛇可以被這種新的冠狀病毒感染并作為宿主。除了哺乳動(dòng)物和Aves(鳥類)以外,沒有一致的證據(jù)證明宿主中存在冠狀病毒?!?/p>

蝙蝠、水貂成候選?

1月24日,北京大學(xué)工學(xué)院教授朱懷球團(tuán)隊(duì)在bioRxiv預(yù)印版平臺(tái)發(fā)表題為《深度學(xué)習(xí)算法預(yù)測(cè)新型冠狀病毒的宿主和感染性》的文章?;谏疃葘W(xué)習(xí)算法開發(fā)的VHP(病毒宿主預(yù)測(cè))方法,推測(cè)出蝙蝠和水貂可能是新型冠狀病毒的兩個(gè)潛在宿主,水貂可能為病毒傳播的中間宿主。

蛇?蝙蝠?水貂?新型冠狀病毒究竟來源于哪種動(dòng)物? 

文中提到,隨著全基因組序列的在線發(fā)布,他們預(yù)測(cè)了新型冠狀病毒2019-nCoV的潛在宿主。結(jié)果顯示,2019-nCoV的6個(gè)基因組均具有較高(p值<0.05)感染人類的可能性。

蛇?蝙蝠?水貂?新型冠狀病毒究竟來源于哪種動(dòng)物?

VHP法提供的50種冠狀病毒潛在宿主的P值(人類冠狀病毒呈紅色,2019-NCoV標(biāo)記為*)

蛇?蝙蝠?水貂?新型冠狀病毒究竟來源于哪種動(dòng)物?

新型冠狀病毒與44種病毒進(jìn)化樹(橙色區(qū)域?yàn)?019-NCoV)

朱懷球團(tuán)隊(duì)研究得出結(jié)論,新型冠狀病毒具有與嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒(SARS-CoV)、蝙蝠SARS樣冠狀病毒(Bat SARS-like CoV)和中東呼吸綜合征冠狀病毒(MERS-CoV)類似的感染人類的強(qiáng)大潛力。

與感染其他脊椎動(dòng)物的冠狀病毒相比,蝙蝠冠狀病毒具有與武漢新型冠狀病毒,即2019-nCoV相似的感染模式。此外,通過比較所有宿主在脊椎動(dòng)物上的病毒傳染模式,發(fā)現(xiàn)水貂病毒的傳染性模式與2019-nCoV更為接近。

該課題組成員之一,浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院第一醫(yī)院、傳染病診治國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室副主任肖永紅對(duì)媒體表示,研究發(fā)現(xiàn),新型冠狀病毒與其他冠狀病毒有相似的傳染過程。蝙蝠身上有多種冠狀病毒,這些冠狀病毒可能先傳染至哺乳動(dòng)物,再傳染到人。比如MERS病毒,中間宿主就是駱駝。對(duì)于新型冠狀病毒來說,研究預(yù)測(cè),蝙蝠是它的最主要來源,中間宿主可能是水貂。

需要指出的是,這一研究并非是基于動(dòng)物實(shí)體的研究,只是采用計(jì)算機(jī)深度學(xué)習(xí)算法來進(jìn)行的數(shù)據(jù)模式推論,準(zhǔn)確性有待商榷。

值得注意的是,23 日,中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研究所石正麗團(tuán)隊(duì)在 bioRxiv 預(yù)印版平臺(tái)上發(fā)文稱,新型冠狀病毒(2019-nCoV)或來源于蝙蝠。

蛇?蝙蝠?水貂?新型冠狀病毒究竟來源于哪種動(dòng)物?

據(jù)了解,石正麗團(tuán)隊(duì)早期從5名患者體內(nèi)獲得了該病毒的全基因組,其中這5例基因組基本上一致,并與SARS-CoV的序列一致性達(dá)79.5%。同時(shí)還發(fā)現(xiàn),2019-nCoV與云南菊頭蝠中存在的RaTG13冠狀病毒的序列一致性高達(dá)96.2%。

另外,早前21日,中國(guó)科學(xué)院上海巴斯德研究所郝沛研究員、軍事醫(yī)學(xué)研究院國(guó)家應(yīng)急防控藥物工程技術(shù)研究中心鐘武研究員和中科院分子植物卓越中心合成生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室李軒研究員合作,在SCIENCE CHINA Life Sciences(中國(guó)科學(xué):生命科學(xué))上發(fā)表論文稱,武漢冠狀病毒和SARS/類SARS冠狀病毒的共同祖先都是和HKU9-1類似的病毒。并推測(cè)和SARS一樣,武漢冠狀病毒的自然宿主也可能是蝙蝠,在從蝙蝠到人的傳染過程中很可能存在未知的中間宿主媒介。

蝙蝠:病毒之王

從目前的幾路研究來看,傾向于認(rèn)為新型冠狀病毒的源頭宿主疑似為蝙蝠,但病毒的中間宿主是什么,仍不明晰。

蛇?蝙蝠?水貂?新型冠狀病毒究竟來源于哪種動(dòng)物?

蝙蝠身上攜帶超過100多種兇險(xiǎn)無比的致病性病毒,被稱為“大自然的活體病毒庫(kù)”,是真正的病毒之王。許多著名病毒的自然宿主都被證實(shí)為蝙蝠。比如埃博拉病毒、尼帕病毒、亨德拉病毒、MERS病毒、SARS病毒等,均被證實(shí)蝙蝠為最初的病毒“元兇”。

為什么蝙蝠會(huì)攜帶那么多病毒?

蝙蝠是一個(gè)古老的物種,是最早的哺乳動(dòng)物之一,有5000萬年的進(jìn)化史,漫長(zhǎng)的進(jìn)化過程使得蝙蝠發(fā)展出了超強(qiáng)的DNA損傷修復(fù)能力,逆天的免疫系統(tǒng)造就了蝙蝠“百毒不侵”的防御功能,雖然攜帶多種病菌,但自身生命力卻極其頑強(qiáng)。且其物種繁多,數(shù)量龐大,目前已知的蝙蝠種類近1200種,占了全球哺乳動(dòng)物總量的五分之一。而且蝙蝠還是除人類之外分布范圍最廣的哺乳類動(dòng)物群,幾乎無處不在。同時(shí),蝙蝠作為唯一會(huì)飛的哺乳動(dòng)物,活動(dòng)范圍強(qiáng)大,而且以群居生活為主,這就導(dǎo)致其接觸和傳播病毒的機(jī)會(huì)大大增加,這也讓很多野生動(dòng)物成為了病毒的中間宿主。

2003年SARS時(shí)期,專家從廣東野生動(dòng)物市場(chǎng)上售賣的果子貍體內(nèi)分離和檢測(cè)到了和SARS病毒完全一樣的病毒。然而,專家調(diào)查了全國(guó)各地的養(yǎng)殖果子貍和野生果子貍,卻發(fā)現(xiàn)它們并沒有被SARS病毒感染的證據(jù)。13年之后,中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研究所石正麗組和崔杰組在SARS冠狀病毒起源獲得突破性進(jìn)展,終于在云南昆明地區(qū)一個(gè)小山洞里的蝙蝠身上發(fā)現(xiàn)了SARS病毒所有基因組成,證實(shí)了SARS病毒的源頭就是蝙蝠。

微博網(wǎng)友@|荷莊|表示:蝙蝠憑一己之力,封印了病毒千年,晝伏夜出,努力扮演一個(gè)孤獨(dú)的潘多拉盒子,并且已經(jīng)盡到最大努力長(zhǎng)得不像個(gè)食材,萬萬還是沒想到,這生生世世的努力,終究是錯(cuò)付了……

蛇?蝙蝠?水貂?新型冠狀病毒究竟來源于哪種動(dòng)物?

雷鋒網(wǎng)小結(jié):

雖說這次新型冠狀病毒的宿主還沒有最終明確,但可以肯定的是,依然和野生動(dòng)物有關(guān)。這場(chǎng)突如其來的疫情,給我們的教訓(xùn),已經(jīng)足夠深刻了。

1月26日,市場(chǎng)監(jiān)管總局、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部、國(guó)家林草局已禁止野生動(dòng)物交易活動(dòng),直至全國(guó)疫情解除。

不過,大家也無需過度恐慌,相信在全國(guó)人民齊心協(xié)力的支持和幫助下,疫情終究會(huì)被戰(zhàn)勝。鐘南山院士表示,這次病毒雖然傳染性比較強(qiáng),但病死率不是特別高。當(dāng)年SARS持續(xù)了五六個(gè)月,相信這個(gè)新型冠狀病毒不會(huì)持續(xù)那么長(zhǎng)?,F(xiàn)在要抓住兩個(gè)要害:早發(fā)現(xiàn),早隔離,這是最原始也是最有效的辦法。

在這里,雷鋒網(wǎng)編輯提醒大家,為了自己和他人的身體健康,請(qǐng)珍愛生命,遠(yuǎn)離“野味”。同時(shí),沒有特殊情況盡量減少外出,外出的話記得戴口罩,勤洗手、勤消毒,做好防護(hù)措施。

參考來源: bioRxiv 、inature、 MedSci梅斯、知識(shí)分子、新京報(bào)、新華網(wǎng)

參考鏈接:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.21.914044v2

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jmv.25682

https://mp.weixin.qq.com/s/NZoHBBzIgSWMlAVNacFTaw

https://xw.qq.com/cmsid/20200125A0CB0R00

http://www.xinhuanet.com/2020-01/27/c_1125504355.htm

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