新冠肺炎爆發(fā)至今已兩月有余，學(xué)者們對病毒源頭的追溯也從未停歇。

研究結(jié)果實(shí)證華南海鮮市場被“冤枉”

2 月 20 日，中國科學(xué)院西雙版納熱帶植物園通過官網(wǎng)發(fā)布研究成果信息稱，武漢華南海鮮市場的新型冠狀病毒是從其他地方傳入的 ，推論此市場不是病毒發(fā)源地。而人際傳播在可能 2019 年 12 月，甚至 11月下旬便開始了。

研究人員收集了截止 2 月 12 日全世界共享到 GISAID EpiFluTM 數(shù)據(jù)庫的病毒數(shù)據(jù)，包括四大洲 12 個國家的 93 個新冠病毒樣本。其中，來自湖北武漢的樣本的取樣截止日期為 1 月 5 日，全球樣本的最晚取樣日期是 2 月 3 日。

• 結(jié)論一：華南海鮮市場的新型冠狀病毒是從其他地方傳入的
  

通過全基因組數(shù)據(jù)解析，研究者發(fā)現(xiàn)收集到的 93 個樣本包含 58 種單倍型（基因類型 haplotypes，即若干個決定同一性狀的緊密連鎖的基因構(gòu)成的基因型），以超級傳播者單倍型為中心，研究者將其歸納為 5組，它們共同構(gòu)成一個病毒進(jìn)化網(wǎng)絡(luò)。5 個中心分別為 3 個古老超級傳播者單倍型 H1 、H3 和 H13 ，以及 2 個新的超級傳播者單倍型 H56 、mv2 。其中，H1 單倍型最多，其衍生單倍型也最多。單倍型演化網(wǎng)絡(luò)顯示，所有單倍型中，單倍型 H13 和 H38 可能是古老/祖先單倍型，它們可能通過一個中間單倍型與蝙蝠冠狀病毒 RaTG13 相關(guān)聯(lián)，由于目前的樣品中沒有第一例感染者的樣本和 12 月初的早期感染者的樣本，最初的古老/祖先單倍型可能還沒有被發(fā)現(xiàn)。

而與華南海鮮市場有關(guān)聯(lián)的患者樣品的單倍型都是 H1 及其衍生的單倍型 H2 及 H8-H12 ，這表明市場在短期內(nèi)存在傳播感染。此外，有一份武漢樣品單倍型 H3 與華南海鮮市場無關(guān)，研究人員認(rèn)為，H1 及其衍生的單倍型可能起源于 H3 ，華南海鮮市場不存在新冠病毒原始來源，新冠病毒可能是從其它地方輸入。此前的研究也顯示，首先確定的受感染患者與市場沒有聯(lián)系，因而研究者認(rèn)為可能是感染者將病毒傳播給市場上的工人或賣方，然后迅速在市場上流通，擁擠的市場促進(jìn)了病毒進(jìn)一步傳播給買家，并于 2019 年 12 月上旬傳播開來。

這個研究也印證了此前 1 月 24 日發(fā)表在《柳葉刀》的研究結(jié)論，即追蹤第一批 41 個確診病例發(fā)現(xiàn)，這批最早在 12 月 1 日報告的病例中，總共有 13 個病例與海鮮市場無接觸史。也就是說，病毒在進(jìn)入海鮮市場之前就已經(jīng)潛入武漢居民的生活中，但華南海鮮市場依舊是病毒擴(kuò)散的“中介”之一。

• 結(jié)論二：新型冠狀病毒或在 12 月初和 1 月 6 日左右發(fā)生過 2 次明顯的種群擴(kuò)張

此外，根據(jù)新型冠狀病毒基因組數(shù)據(jù)推算 1 月之前的種群擴(kuò)張發(fā)生時間是 12 月 8 日，該結(jié)果暗示病毒可能在 12 月初，甚至 11 月下旬即已經(jīng)開始有人際傳播，隨后在華南海鮮市場加快了人際傳播。研究推算 2 月份之前的種群擴(kuò)張時間在 1 月 6 日，這個可能與元旦假期有關(guān)聯(lián)。需要指出，這一天國家疾控中心發(fā)布了 2級應(yīng)急響應(yīng)。當(dāng)時的預(yù)警起到了一些警示作用，公眾活動和出行都有所減少。

如果當(dāng)時的警示能引起大眾更廣泛的重視，那么1月份中下旬向全國和全球蔓延的病例會有所降低。研究人員進(jìn)一步確認(rèn)我國其他 9個省區(qū)和其他 11 個國家的感染病例基本都是從武漢直接或者間接輸入而來。

• 結(jié)論三：現(xiàn)擴(kuò)散的病例至少來自于 3 個途徑

另外，為了能夠細(xì)分來源，研究人員將 58 種單倍型分成了五組，采用標(biāo)準(zhǔn)是 3 個中心（古老超級傳播者）單倍型（H1, H3 和 H13 ）和 2個 新的超級傳播者單倍型（ H56 和 mv 2）。以此鑒別出廣東的病毒可能有三個來源，重慶和臺灣的病毒有兩個來源。

其中，廣東深圳一家人在早期就通過人傳人進(jìn)行了傳播。有較多樣本的澳大利亞、法國、日本和美國，他們的患者感染源至少有兩個，尤其是美國包括了五個來源。

非常值得關(guān)注的是 H56 這個超級傳播者單倍型，它同時是澳大利亞、法國和美國，以及我國臺灣患者的傳染源。其他國家患者因?yàn)闃悠繁容^少，大多數(shù)的來源比較單一，他們除了是武漢旅游輸入或在武漢感染外，有一些人可能是在廣東、新加坡等地被感染。

• 結(jié)論四，新冠病毒基因組尚未發(fā)生重組事件

好消息是，研究人員發(fā)現(xiàn)新冠病毒基因組沒有發(fā)生明顯的重組事件。他們在 8 個蛋白質(zhì)編碼區(qū)發(fā)現(xiàn)了120 個核苷酸突變點(diǎn)位，基因組中的 10 個蛋白質(zhì)編碼區(qū)的突變點(diǎn)位均勻分布。

120 個突變的核苷酸關(guān)聯(lián)了 119 個氨基酸密碼子，其中 79 個密碼子 （ 65.83% ）改變了氨基酸類型，并有 42 個（ 53.17% ）氨基酸理化性質(zhì)都被改變。目前研究者尚不清楚這些氨基酸類型以及理化性質(zhì)改變是否會影響新冠病毒的活性，需要其他蛋白組學(xué)和結(jié)構(gòu)生物學(xué)方面的專業(yè)人士進(jìn)行驗(yàn)證。

美國或?qū)⑹遣《驹搭^？

誠然，確定海鮮市場是不是病毒發(fā)源地對于尋找病毒的來源，以及確定中間宿主，對疫情的控制和避免再次爆發(fā)具有至關(guān)重要的意義，但吃瓜群眾們對病毒源頭究竟是誰更為撲朔迷離。 

日本朝日電視臺昨日傍晚報道，宣稱“ CDC 美國疾病管理預(yù)防中心發(fā)布驚人的消息，懷疑一萬多的流感死亡人數(shù)中，有一部分是死于新冠肺炎的，檢查體制有漏洞，已經(jīng)開始新的檢測方式，并呼吁有新冠癥狀的患者重新檢查……”

網(wǎng)友們便開始猜測：難道幕后的黑手是美軍？

但問題是，即便幕后黑手是美國，美國為什么要這么做呢？

按照網(wǎng)友們的猜測，美國來中國參加軍運(yùn)會時，美國正在爆發(fā)流感，最后一批最晚 11 月 15 日離開， 12 月底武漢就發(fā)現(xiàn)了受感染的新冠病毒患者，時間不可謂不巧合......但這似乎也不是我們應(yīng)該懷疑美國的理由，畢竟，在真相出來之前，誰都不能妄下定論。

帶著好奇心，雷鋒網(wǎng)編輯也查詢了 CDC 官方網(wǎng)站，我們發(fā)現(xiàn)在其最新更新的報告中有很多有關(guān)“很多病人患的  并不是流感”的內(nèi)容，但部分人的流感病毒類型尚未確定，而 CDC 也并未指出，該類型尚未確定的流感病毒就是新型冠狀病毒，也沒有指出美國因流感死亡的人中，有人是死于患有新冠肺炎。當(dāng)然，美國 CDC 也沒有說過“美國流感可能掩蓋了新冠病毒在美國的傳播”。

此外，CDC 也在原文報道中稱，現(xiàn)在是流感季，令發(fā)現(xiàn)/確診新冠肺炎變得更加困難，因此 CDC 將與五個實(shí)驗(yàn)室合作，利用其現(xiàn)有流感監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)來測試具有類流感癥狀的人是否有新冠肺炎，而上述措施只是為了預(yù)防流感更大范圍的流行。

顯然，日媒報道的這一新聞有“夸大其詞”之嫌。

所以，雷鋒網(wǎng)在這里建議大家：不要陰謀論，不要陰謀論，不要陰謀論！不要偏聽偏信，要實(shí)事求是。當(dāng)下，最為緊要的還是要先找到零號病人。雷鋒網(wǎng)雷鋒網(wǎng)

參考資料：

美國 CDC 數(shù)據(jù)

Decoding evolution and transmissions of novel pneumonia coronavirus using the whole genomic data                    

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